Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PDE4AP27815 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
PDE4AP27815 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PDE4AP27815 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PDE4AP27815 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PDE4AP27815 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PDE4AP27815 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PDE4AP27815 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PDE4AP27815 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PDE4AP27815 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PDE4AP27815 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PDE4AP27815 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PDE4AP27815 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PDE4AP27815 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PDE4AP27815 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PDE4AP27815 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PDE4AP27815 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PDE4AP27815 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PDE4AP27815 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PDE4AP27815 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PDE4AP27815 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
PDE4AP27815 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PDE4AP27815 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PDE4AP27815 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PDE4AP27815 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PDE4AP27815 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PDE4AP27815 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PDE4AP27815 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PDE4AP27815 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PDE4AP27815 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PDE4AP27815 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PDE4AP27815 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PDE4AP27815 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PDE4AP27815 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PDE4AP27815 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PDE4AP27815 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PDE4AP27815 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
PDE4AP27815 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PDE4AP27815 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.14
PDE4AP27815 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PDE4AP27815 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PDE4AP27815 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PDE4AP27815 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PDE4AP27815 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PDE4AP27815 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PDE4AP27815 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PDE4AP27815 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PDE4AP27815 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PDE4AP27815 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PDE4AP27815 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PDE4AP27815 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PDE4AP27815 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PDE4AP27815 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PDE4AP27815 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PDE4AP27815 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PDE4AP27815 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PDE4AP27815 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PDE4AP27815 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PDE4AP27815 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PDE4AP27815 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PDE4AP27815 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PDE4AP27815 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PDE4AP27815 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PDE4AP27815 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PDE4AP27815 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PDE4AP27815 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PDE4AP27815 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PDE4AP27815 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PDE4AP27815 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
PDE4AP27815 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PDE4AP27815 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PDE4AP27815 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PDE4AP27815 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PDE4AP27815 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PDE4AP27815 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PDE4AP27815 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PDE4AP27815 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PDE4AP27815 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PDE4AP27815 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PDE4AP27815 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PDE4AP27815 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PDE4AP27815 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PDE4AP27815 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PDE4AP27815 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PDE4AP27815 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PDE4AP27815 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PDE4AP27815 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PDE4AP27815 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PDE4AP27815 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PDE4AP27815 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PDE4AP27815 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PDE4AP27815 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PDE4AP27815 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PDE4AP27815 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PDE4AP27815 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PDE4AP27815 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PDE4AP27815 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PDE4AP27815 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
PDE4AP27815 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PDE4AP27815 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms