Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
POLR2AP24928 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
POLR2AP24928 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
POLR2AP24928 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
POLR2AP24928 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
POLR2AP24928 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
POLR2AP24928 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
POLR2AP24928 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
POLR2AP24928 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
POLR2AP24928 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
POLR2AP24928 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
POLR2AP24928 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
POLR2AP24928 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
POLR2AP24928 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
POLR2AP24928 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.79■■■■□ 3
POLR2AP24928 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
POLR2AP24928 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
POLR2AP24928 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
POLR2AP24928 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
POLR2AP24928 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
POLR2AP24928 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
POLR2AP24928 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
POLR2AP24928 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
POLR2AP24928 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
POLR2AP24928 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
POLR2AP24928 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
POLR2AP24928 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
POLR2AP24928 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
POLR2AP24928 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
POLR2AP24928 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
POLR2AP24928 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
POLR2AP24928 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
POLR2AP24928 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
POLR2AP24928 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
POLR2AP24928 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
POLR2AP24928 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
POLR2AP24928 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
POLR2AP24928 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
POLR2AP24928 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
POLR2AP24928 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
POLR2AP24928 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
POLR2AP24928 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
POLR2AP24928 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
POLR2AP24928 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
POLR2AP24928 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
POLR2AP24928 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
POLR2AP24928 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
POLR2AP24928 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
POLR2AP24928 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
POLR2AP24928 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
POLR2AP24928 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
POLR2AP24928 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLR2AP24928 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLR2AP24928 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
POLR2AP24928 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
POLR2AP24928 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
POLR2AP24928 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
POLR2AP24928 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
POLR2AP24928 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
POLR2AP24928 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
POLR2AP24928 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
POLR2AP24928 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
POLR2AP24928 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
POLR2AP24928 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
POLR2AP24928 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
POLR2AP24928 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
POLR2AP24928 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
POLR2AP24928 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
POLR2AP24928 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
POLR2AP24928 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
POLR2AP24928 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
POLR2AP24928 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
POLR2AP24928 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
POLR2AP24928 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
POLR2AP24928 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
POLR2AP24928 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
POLR2AP24928 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
POLR2AP24928 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
POLR2AP24928 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
POLR2AP24928 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
POLR2AP24928 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
POLR2AP24928 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
POLR2AP24928 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
POLR2AP24928 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
POLR2AP24928 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
POLR2AP24928 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
POLR2AP24928 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
POLR2AP24928 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
POLR2AP24928 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
POLR2AP24928 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
POLR2AP24928 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
POLR2AP24928 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
POLR2AP24928 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLR2AP24928 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLR2AP24928 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
POLR2AP24928 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
POLR2AP24928 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
POLR2AP24928 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
POLR2AP24928 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
POLR2AP24928 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms