Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKCHP24723 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKCHP24723 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKCHP24723 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKCHP24723 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKCHP24723 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKCHP24723 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKCHP24723 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRKCHP24723 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PRKCHP24723 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKCHP24723 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKCHP24723 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKCHP24723 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKCHP24723 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKCHP24723 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKCHP24723 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKCHP24723 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKCHP24723 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKCHP24723 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKCHP24723 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKCHP24723 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKCHP24723 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKCHP24723 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKCHP24723 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRKCHP24723 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKCHP24723 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKCHP24723 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKCHP24723 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKCHP24723 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKCHP24723 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKCHP24723 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKCHP24723 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKCHP24723 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKCHP24723 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKCHP24723 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKCHP24723 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKCHP24723 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKCHP24723 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKCHP24723 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKCHP24723 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKCHP24723 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKCHP24723 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKCHP24723 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKCHP24723 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKCHP24723 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKCHP24723 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKCHP24723 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKCHP24723 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKCHP24723 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKCHP24723 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKCHP24723 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKCHP24723 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKCHP24723 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKCHP24723 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRKCHP24723 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRKCHP24723 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRKCHP24723 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKCHP24723 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKCHP24723 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRKCHP24723 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKCHP24723 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKCHP24723 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKCHP24723 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKCHP24723 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKCHP24723 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKCHP24723 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKCHP24723 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKCHP24723 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKCHP24723 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKCHP24723 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKCHP24723 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRKCHP24723 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKCHP24723 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKCHP24723 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKCHP24723 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKCHP24723 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKCHP24723 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKCHP24723 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKCHP24723 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKCHP24723 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKCHP24723 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKCHP24723 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKCHP24723 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKCHP24723 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKCHP24723 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKCHP24723 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKCHP24723 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKCHP24723 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKCHP24723 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKCHP24723 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKCHP24723 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKCHP24723 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKCHP24723 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKCHP24723 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKCHP24723 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKCHP24723 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKCHP24723 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKCHP24723 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKCHP24723 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKCHP24723 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms