Protein–RNA interactions for Protein: P23246

SFPQ, Splicing factor, proline- and glutamine-rich, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFPQP23246 CDH2-205ENST00000430882 610 ntTSL 44.65□□□□□ -1.671e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 CCNI-206ENST00000511943 576 ntTSL 34.2□□□□□ -1.741e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 NDRG1-213ENST00000519580 550 ntTSL 514.49□□□□□ -0.093e-7■■■■■ 28.5
SFPQP23246 NDRG1-224ENST00000522738 530 ntTSL 512.78□□□□□ -0.363e-7■■■■■ 28.5
SFPQP23246 RHBDF2-216ENST00000592123 935 ntTSL 524.65■■□□□ 1.549e-9■■■■■ 28.4
SFPQP23246 RHBDF2-218ENST00000593103 562 ntTSL 521.84■■□□□ 1.099e-9■■■■■ 28.4
SFPQP23246 RHBDF2-208ENST00000590288 734 ntTSL 421.81■■□□□ 1.089e-9■■■■■ 28.4
SFPQP23246 RHBDF2-203ENST00000585989 568 ntTSL 421.74■■□□□ 1.079e-9■■■■■ 28.4
SFPQP23246 RHBDF2-212ENST00000591697 613 ntTSL 421.53■■□□□ 1.049e-9■■■■■ 28.4
SFPQP23246 RHBDF2-217ENST00000592378 533 ntTSL 420.44■□□□□ 0.869e-9■■■■■ 28.4
SFPQP23246 RHBDF2-211ENST00000591255 545 ntTSL 419.5■□□□□ 0.719e-9■■■■■ 28.4
SFPQP23246 NSD2-218ENST00000508355 2092 ntTSL 1 (best)15.81■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 28.4
SFPQP23246 NSD2-216ENST00000507820 528 ntTSL 514.29□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 28.4
SFPQP23246 RHBDF2-201ENST00000313080 3582 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.39e-9■■■■■ 28.4
SFPQP23246 RHBDF2-215ENST00000591885 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.329e-9■■■■■ 28.4
SFPQP23246 NSD2-224ENST00000514045 3964 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.92e-6■■■■■ 28.4
SFPQP23246 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.657e-7■■■■■ 28
SFPQP23246 NDRG1-210ENST00000518480 558 ntTSL 418.47■□□□□ 0.557e-7■■■■■ 28
SFPQP23246 NDRG1-225ENST00000522890 581 ntTSL 517.83■□□□□ 0.447e-7■■■■■ 28
SFPQP23246 NDRG1-211ENST00000519228 729 ntTSL 416.95■□□□□ 0.37e-7■■■■■ 28
SFPQP23246 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.137e-7■■■■■ 28
SFPQP23246 NDRG1-214ENST00000520230 582 ntTSL 415.06■□□□□ 07e-7■■■■■ 28
SFPQP23246 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.037e-7■■■■■ 28
SFPQP23246 NDRG1-206ENST00000518010 581 ntTSL 414.66□□□□□ -0.067e-7■■■■■ 28
SFPQP23246 NDRG1-219ENST00000521544 709 ntTSL 514.49□□□□□ -0.097e-7■■■■■ 28
SFPQP23246 NDRG1-221ENST00000522377 1103 ntTSL 514□□□□□ -0.177e-7■■■■■ 28
SFPQP23246 NDRG1-204ENST00000517599 2918 ntTSL 213.85□□□□□ -0.197e-7■■■■■ 28
SFPQP23246 NDRG1-229ENST00000537882 2975 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.297e-7■■■■■ 28
SFPQP23246 NDRG1-207ENST00000518066 560 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.37e-7■■■■■ 28
SFPQP23246 NDRG1-201ENST00000323851 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.437e-7■■■■■ 28
SFPQP23246 NDRG1-215ENST00000520943 536 ntTSL 411.28□□□□□ -0.67e-7■■■■■ 28
SFPQP23246 NDRG1-227ENST00000523892 562 ntTSL 49.81□□□□□ -0.847e-7■■■■■ 28
SFPQP23246 SEPT9-216ENST00000586812 466 ntTSL 222.73■■□□□ 1.231e-7■■■■■ 28
SFPQP23246 ZXDC-203ENST00000514463 4639 ntTSL 1 (best)16.11■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 28
SFPQP23246 SEPT9-232ENST00000590825 554 ntTSL 415.66■□□□□ 0.11e-7■■■■■ 28
SFPQP23246 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.778e-9■■■■■ 27.5
SFPQP23246 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.542e-7■■■■■ 27.5
SFPQP23246 GNA11-203ENST00000586763 354 ntTSL 317.76■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 27.5
SFPQP23246 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 02e-6■■■■■ 27.5
SFPQP23246 ELOVL6-205ENST00000506625 610 ntTSL 410.74□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 27.5
SFPQP23246 ELOVL6-204ENST00000506461 575 ntTSL 49.74□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 27.5
SFPQP23246 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.312e-6■■■■■ 27.5
SFPQP23246 ELOVL6-203ENST00000503885 458 ntTSL 45.74□□□□□ -1.492e-6■■■■■ 27.5
SFPQP23246 ELOVL6-208ENST00000514184 607 ntTSL 34.21□□□□□ -1.742e-6■■■■■ 27.5
SFPQP23246 ADARB1-207ENST00000460734 2523 ntTSL 1 (best)28.1■■■□□ 2.095e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 FAM129B-207ENST00000484348 654 ntTSL 1 (best)25.75■■□□□ 1.713e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)24.66■■□□□ 1.545e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.545e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 ADARB1-212ENST00000496664 5033 ntTSL 1 (best)24.66■■□□□ 1.545e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)23.55■■□□□ 1.365e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.223e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 SFXN5-214ENST00000482289 895 ntTSL 1 (best)22.53■■□□□ 1.23e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 LPP-204ENST00000420410 535 ntTSL 321.28■■□□□ 13e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.985e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 CORO1C-216ENST00000551059 474 ntTSL 220.84■□□□□ 0.933e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.893e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 CORO1C-219ENST00000552871 587 ntTSL 320.41■□□□□ 0.863e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 CORO1C-214ENST00000550542 1245 ntTSL 520.41■□□□□ 0.863e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 CORO1C-210ENST00000549384 891 ntTSL 520.2■□□□□ 0.823e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.733e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.685e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 SFXN5-221ENST00000495208 808 ntTSL 1 (best)19.07■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 SH3BP4-211ENST00000493436 481 ntTSL 318.69■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.553e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 SFXN5-220ENST00000490056 906 ntTSL 1 (best)18.46■□□□□ 0.553e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.513e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 SDF4-207ENST00000494748 3516 ntTSL 217.86■□□□□ 0.453e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 G3BP2-206ENST00000503660 1071 ntTSL 517.77■□□□□ 0.443e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 CIC-208ENST00000575839 335 ntTSL 517.61■□□□□ 0.413e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.365e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 VGLL4-212ENST00000437722 544 ntTSL 317.26■□□□□ 0.355e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.33e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.33e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 SFXN5-203ENST00000411783 915 ntTSL 316.84■□□□□ 0.293e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 VGLL4-209ENST00000424709 437 ntTSL 316.59■□□□□ 0.255e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.243e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 G3BP2-219ENST00000515457 560 ntTSL 416.55■□□□□ 0.243e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 G3BP2-205ENST00000502654 546 ntTSL 416.55■□□□□ 0.243e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 FAM129B-204ENST00000468379 828 ntTSL 316■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 ZNF331-221ENST00000514022 913 ntTSL 215.94■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 ZNF331-211ENST00000509047 670 ntTSL 315.87■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 LPP-207ENST00000443217 400 ntTSL 315.83■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 VGLL4-215ENST00000458499 766 ntTSL 315.59■□□□□ 0.095e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 FAM129B-206ENST00000478917 362 ntTSL 515.58■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 CORO1C-205ENST00000546571 899 ntTSL 415.11■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 ZNF331-215ENST00000511567 540 ntTSL 414.7□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 CORO1C-201ENST00000261401 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 G3BP2-201ENST00000357854 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 G3BP2-218ENST00000513927 426 ntTSL 313.5□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 SFXN5-211ENST00000474528 4072 ntTSL 1 (best)13.43□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 ZNF331-213ENST00000509585 562 ntTSL 513.31□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 SFXN5-207ENST00000461352 3578 ntTSL 1 (best)13.3□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 HNF4G-204ENST00000494318 470 ntTSL 312.86□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 SFXN5-202ENST00000410065 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.373e-6■■■■■ 27.1
SFPQP23246 SFXN5-201ENST00000272433 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 27.1
Retrieved 100 of 4,991 protein–RNA pairs in 28.2 ms