Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RFX1P22670 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RFX1P22670 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RFX1P22670 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RFX1P22670 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RFX1P22670 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RFX1P22670 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RFX1P22670 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RFX1P22670 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RFX1P22670 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RFX1P22670 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RFX1P22670 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RFX1P22670 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RFX1P22670 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RFX1P22670 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RFX1P22670 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RFX1P22670 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RFX1P22670 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RFX1P22670 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RFX1P22670 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RFX1P22670 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
RFX1P22670 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RFX1P22670 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RFX1P22670 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RFX1P22670 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RFX1P22670 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RFX1P22670 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RFX1P22670 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RFX1P22670 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RFX1P22670 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RFX1P22670 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RFX1P22670 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RFX1P22670 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RFX1P22670 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
RFX1P22670 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RFX1P22670 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RFX1P22670 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RFX1P22670 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RFX1P22670 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RFX1P22670 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RFX1P22670 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RFX1P22670 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RFX1P22670 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RFX1P22670 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RFX1P22670 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RFX1P22670 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RFX1P22670 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RFX1P22670 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RFX1P22670 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RFX1P22670 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RFX1P22670 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RFX1P22670 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RFX1P22670 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
RFX1P22670 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RFX1P22670 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RFX1P22670 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RFX1P22670 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RFX1P22670 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
RFX1P22670 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RFX1P22670 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RFX1P22670 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RFX1P22670 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RFX1P22670 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RFX1P22670 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RFX1P22670 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RFX1P22670 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RFX1P22670 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RFX1P22670 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RFX1P22670 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RFX1P22670 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RFX1P22670 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RFX1P22670 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RFX1P22670 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RFX1P22670 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RFX1P22670 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RFX1P22670 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RFX1P22670 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RFX1P22670 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RFX1P22670 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RFX1P22670 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RFX1P22670 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RFX1P22670 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RFX1P22670 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RFX1P22670 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RFX1P22670 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RFX1P22670 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RFX1P22670 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RFX1P22670 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RFX1P22670 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RFX1P22670 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RFX1P22670 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RFX1P22670 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RFX1P22670 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
RFX1P22670 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RFX1P22670 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RFX1P22670 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RFX1P22670 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RFX1P22670 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RFX1P22670 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RFX1P22670 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms