Protein–RNA interactions for Protein: P22459

KCNA4, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA4P22459 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNA4P22459 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNA4P22459 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNA4P22459 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNA4P22459 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNA4P22459 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNA4P22459 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNA4P22459 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNA4P22459 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNA4P22459 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNA4P22459 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNA4P22459 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNA4P22459 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNA4P22459 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNA4P22459 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNA4P22459 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNA4P22459 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNA4P22459 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNA4P22459 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KCNA4P22459 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KCNA4P22459 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNA4P22459 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNA4P22459 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNA4P22459 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNA4P22459 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNA4P22459 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNA4P22459 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNA4P22459 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNA4P22459 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNA4P22459 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNA4P22459 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNA4P22459 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNA4P22459 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNA4P22459 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNA4P22459 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNA4P22459 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNA4P22459 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNA4P22459 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNA4P22459 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNA4P22459 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNA4P22459 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNA4P22459 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNA4P22459 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNA4P22459 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNA4P22459 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNA4P22459 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNA4P22459 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNA4P22459 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNA4P22459 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNA4P22459 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNA4P22459 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNA4P22459 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNA4P22459 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNA4P22459 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNA4P22459 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNA4P22459 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNA4P22459 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNA4P22459 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNA4P22459 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNA4P22459 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNA4P22459 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNA4P22459 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNA4P22459 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNA4P22459 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNA4P22459 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNA4P22459 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNA4P22459 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNA4P22459 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNA4P22459 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNA4P22459 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNA4P22459 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNA4P22459 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNA4P22459 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNA4P22459 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNA4P22459 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNA4P22459 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNA4P22459 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
KCNA4P22459 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNA4P22459 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNA4P22459 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNA4P22459 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNA4P22459 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNA4P22459 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNA4P22459 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNA4P22459 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNA4P22459 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNA4P22459 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNA4P22459 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNA4P22459 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNA4P22459 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNA4P22459 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNA4P22459 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNA4P22459 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNA4P22459 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNA4P22459 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNA4P22459 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KCNA4P22459 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNA4P22459 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNA4P22459 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNA4P22459 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms