Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCMT1P22061 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PCMT1P22061 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PCMT1P22061 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCMT1P22061 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCMT1P22061 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCMT1P22061 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCMT1P22061 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCMT1P22061 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PCMT1P22061 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCMT1P22061 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCMT1P22061 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCMT1P22061 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCMT1P22061 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCMT1P22061 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCMT1P22061 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PCMT1P22061 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCMT1P22061 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCMT1P22061 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCMT1P22061 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCMT1P22061 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCMT1P22061 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PCMT1P22061 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCMT1P22061 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCMT1P22061 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCMT1P22061 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCMT1P22061 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCMT1P22061 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCMT1P22061 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCMT1P22061 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCMT1P22061 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCMT1P22061 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCMT1P22061 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCMT1P22061 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCMT1P22061 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCMT1P22061 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCMT1P22061 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCMT1P22061 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCMT1P22061 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCMT1P22061 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCMT1P22061 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCMT1P22061 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCMT1P22061 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCMT1P22061 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCMT1P22061 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCMT1P22061 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCMT1P22061 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCMT1P22061 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCMT1P22061 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCMT1P22061 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCMT1P22061 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCMT1P22061 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCMT1P22061 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCMT1P22061 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCMT1P22061 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCMT1P22061 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCMT1P22061 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCMT1P22061 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCMT1P22061 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCMT1P22061 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCMT1P22061 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCMT1P22061 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCMT1P22061 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCMT1P22061 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCMT1P22061 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCMT1P22061 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCMT1P22061 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCMT1P22061 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PCMT1P22061 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCMT1P22061 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCMT1P22061 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCMT1P22061 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCMT1P22061 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCMT1P22061 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCMT1P22061 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCMT1P22061 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCMT1P22061 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCMT1P22061 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCMT1P22061 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCMT1P22061 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCMT1P22061 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCMT1P22061 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCMT1P22061 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PCMT1P22061 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCMT1P22061 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCMT1P22061 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCMT1P22061 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCMT1P22061 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCMT1P22061 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCMT1P22061 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCMT1P22061 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCMT1P22061 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCMT1P22061 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCMT1P22061 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCMT1P22061 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCMT1P22061 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCMT1P22061 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCMT1P22061 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCMT1P22061 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCMT1P22061 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms