Protein–RNA interactions for Protein: P21741

MDK, Midkine, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDKP21741 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDKP21741 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDKP21741 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDKP21741 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDKP21741 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDKP21741 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDKP21741 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MDKP21741 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDKP21741 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDKP21741 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MDKP21741 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDKP21741 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDKP21741 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDKP21741 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDKP21741 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDKP21741 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDKP21741 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDKP21741 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDKP21741 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDKP21741 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDKP21741 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MDKP21741 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDKP21741 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDKP21741 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDKP21741 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDKP21741 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDKP21741 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDKP21741 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDKP21741 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MDKP21741 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDKP21741 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDKP21741 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDKP21741 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDKP21741 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDKP21741 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDKP21741 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDKP21741 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDKP21741 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDKP21741 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDKP21741 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDKP21741 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDKP21741 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDKP21741 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDKP21741 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDKP21741 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDKP21741 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDKP21741 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MDKP21741 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDKP21741 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDKP21741 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDKP21741 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDKP21741 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDKP21741 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDKP21741 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDKP21741 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDKP21741 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDKP21741 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDKP21741 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDKP21741 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MDKP21741 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDKP21741 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDKP21741 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDKP21741 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDKP21741 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDKP21741 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDKP21741 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDKP21741 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDKP21741 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDKP21741 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDKP21741 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDKP21741 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDKP21741 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDKP21741 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDKP21741 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDKP21741 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDKP21741 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDKP21741 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDKP21741 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDKP21741 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDKP21741 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDKP21741 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDKP21741 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDKP21741 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDKP21741 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDKP21741 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDKP21741 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDKP21741 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDKP21741 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDKP21741 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDKP21741 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDKP21741 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDKP21741 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDKP21741 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDKP21741 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDKP21741 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDKP21741 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDKP21741 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDKP21741 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDKP21741 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDKP21741 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms