Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHA1P21709 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHA1P21709 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHA1P21709 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA1P21709 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA1P21709 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA1P21709 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA1P21709 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHA1P21709 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHA1P21709 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPHA1P21709 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPHA1P21709 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHA1P21709 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHA1P21709 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHA1P21709 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHA1P21709 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHA1P21709 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHA1P21709 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHA1P21709 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHA1P21709 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHA1P21709 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHA1P21709 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHA1P21709 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHA1P21709 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHA1P21709 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA1P21709 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA1P21709 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA1P21709 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHA1P21709 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA1P21709 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA1P21709 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA1P21709 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHA1P21709 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHA1P21709 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHA1P21709 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHA1P21709 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHA1P21709 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHA1P21709 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHA1P21709 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA1P21709 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA1P21709 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA1P21709 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA1P21709 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA1P21709 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA1P21709 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHA1P21709 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHA1P21709 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA1P21709 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA1P21709 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHA1P21709 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHA1P21709 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHA1P21709 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHA1P21709 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHA1P21709 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHA1P21709 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHA1P21709 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHA1P21709 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPHA1P21709 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHA1P21709 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHA1P21709 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHA1P21709 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHA1P21709 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHA1P21709 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA1P21709 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA1P21709 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA1P21709 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA1P21709 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHA1P21709 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHA1P21709 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHA1P21709 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHA1P21709 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EPHA1P21709 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA1P21709 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA1P21709 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA1P21709 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHA1P21709 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHA1P21709 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHA1P21709 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHA1P21709 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHA1P21709 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHA1P21709 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHA1P21709 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHA1P21709 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHA1P21709 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHA1P21709 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHA1P21709 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA1P21709 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA1P21709 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHA1P21709 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHA1P21709 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHA1P21709 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHA1P21709 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHA1P21709 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHA1P21709 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHA1P21709 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHA1P21709 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHA1P21709 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHA1P21709 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHA1P21709 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHA1P21709 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms