Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TAF1P21675 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TAF1P21675 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TAF1P21675 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
TAF1P21675 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TAF1P21675 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TAF1P21675 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TAF1P21675 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TAF1P21675 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TAF1P21675 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TAF1P21675 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TAF1P21675 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TAF1P21675 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TAF1P21675 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TAF1P21675 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TAF1P21675 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
TAF1P21675 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
TAF1P21675 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
TAF1P21675 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TAF1P21675 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TAF1P21675 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TAF1P21675 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TAF1P21675 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TAF1P21675 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TAF1P21675 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TAF1P21675 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TAF1P21675 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TAF1P21675 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TAF1P21675 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TAF1P21675 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TAF1P21675 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TAF1P21675 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TAF1P21675 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TAF1P21675 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TAF1P21675 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TAF1P21675 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TAF1P21675 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TAF1P21675 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TAF1P21675 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TAF1P21675 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TAF1P21675 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TAF1P21675 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
TAF1P21675 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TAF1P21675 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TAF1P21675 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TAF1P21675 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TAF1P21675 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
TAF1P21675 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TAF1P21675 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TAF1P21675 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TAF1P21675 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TAF1P21675 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TAF1P21675 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TAF1P21675 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TAF1P21675 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TAF1P21675 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TAF1P21675 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TAF1P21675 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TAF1P21675 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TAF1P21675 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TAF1P21675 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TAF1P21675 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TAF1P21675 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TAF1P21675 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TAF1P21675 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TAF1P21675 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TAF1P21675 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TAF1P21675 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TAF1P21675 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
TAF1P21675 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TAF1P21675 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
TAF1P21675 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TAF1P21675 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TAF1P21675 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
TAF1P21675 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TAF1P21675 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
TAF1P21675 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TAF1P21675 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TAF1P21675 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TAF1P21675 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TAF1P21675 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
TAF1P21675 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TAF1P21675 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TAF1P21675 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TAF1P21675 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TAF1P21675 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TAF1P21675 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TAF1P21675 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TAF1P21675 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TAF1P21675 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TAF1P21675 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TAF1P21675 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TAF1P21675 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TAF1P21675 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TAF1P21675 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TAF1P21675 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TAF1P21675 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TAF1P21675 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TAF1P21675 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TAF1P21675 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms