Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF1P18846 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATF1P18846 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF1P18846 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF1P18846 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF1P18846 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF1P18846 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF1P18846 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF1P18846 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF1P18846 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF1P18846 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF1P18846 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATF1P18846 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF1P18846 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF1P18846 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF1P18846 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF1P18846 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF1P18846 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF1P18846 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF1P18846 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF1P18846 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF1P18846 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF1P18846 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF1P18846 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF1P18846 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF1P18846 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF1P18846 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF1P18846 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF1P18846 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF1P18846 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF1P18846 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF1P18846 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF1P18846 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF1P18846 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF1P18846 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF1P18846 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF1P18846 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATF1P18846 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATF1P18846 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATF1P18846 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF1P18846 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF1P18846 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF1P18846 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF1P18846 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF1P18846 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF1P18846 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF1P18846 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATF1P18846 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF1P18846 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF1P18846 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF1P18846 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF1P18846 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF1P18846 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF1P18846 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF1P18846 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF1P18846 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF1P18846 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF1P18846 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF1P18846 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF1P18846 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF1P18846 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF1P18846 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF1P18846 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF1P18846 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF1P18846 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF1P18846 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF1P18846 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF1P18846 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF1P18846 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF1P18846 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF1P18846 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF1P18846 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF1P18846 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF1P18846 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF1P18846 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF1P18846 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF1P18846 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATF1P18846 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF1P18846 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF1P18846 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF1P18846 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF1P18846 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF1P18846 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF1P18846 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF1P18846 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF1P18846 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATF1P18846 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATF1P18846 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF1P18846 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF1P18846 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF1P18846 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATF1P18846 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATF1P18846 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF1P18846 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF1P18846 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF1P18846 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF1P18846 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF1P18846 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF1P18846 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF1P18846 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms