Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GJA1P17302 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJA1P17302 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJA1P17302 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
GJA1P17302 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJA1P17302 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJA1P17302 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJA1P17302 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJA1P17302 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJA1P17302 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJA1P17302 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJA1P17302 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GJA1P17302 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJA1P17302 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJA1P17302 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJA1P17302 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJA1P17302 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GJA1P17302 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJA1P17302 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GJA1P17302 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
GJA1P17302 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GJA1P17302 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJA1P17302 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GJA1P17302 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GJA1P17302 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJA1P17302 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GJA1P17302 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJA1P17302 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJA1P17302 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GJA1P17302 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GJA1P17302 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GJA1P17302 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJA1P17302 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GJA1P17302 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJA1P17302 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJA1P17302 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJA1P17302 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJA1P17302 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJA1P17302 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJA1P17302 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJA1P17302 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJA1P17302 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJA1P17302 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJA1P17302 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJA1P17302 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJA1P17302 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJA1P17302 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GJA1P17302 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJA1P17302 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJA1P17302 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GJA1P17302 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GJA1P17302 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJA1P17302 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJA1P17302 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJA1P17302 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJA1P17302 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJA1P17302 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJA1P17302 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJA1P17302 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJA1P17302 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJA1P17302 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJA1P17302 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJA1P17302 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GJA1P17302 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJA1P17302 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJA1P17302 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GJA1P17302 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GJA1P17302 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJA1P17302 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GJA1P17302 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJA1P17302 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJA1P17302 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GJA1P17302 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GJA1P17302 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GJA1P17302 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJA1P17302 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJA1P17302 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJA1P17302 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJA1P17302 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJA1P17302 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJA1P17302 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJA1P17302 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJA1P17302 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJA1P17302 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJA1P17302 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJA1P17302 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
GJA1P17302 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GJA1P17302 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJA1P17302 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJA1P17302 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GJA1P17302 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJA1P17302 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJA1P17302 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GJA1P17302 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJA1P17302 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJA1P17302 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJA1P17302 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJA1P17302 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJA1P17302 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJA1P17302 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms