Protein–RNA interactions for Protein: P15514

AREG, Amphiregulin, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AREGP15514 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AREGP15514 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AREGP15514 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AREGP15514 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AREGP15514 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AREGP15514 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AREGP15514 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AREGP15514 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AREGP15514 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AREGP15514 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AREGP15514 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AREGP15514 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AREGP15514 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AREGP15514 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AREGP15514 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AREGP15514 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AREGP15514 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AREGP15514 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AREGP15514 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AREGP15514 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AREGP15514 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AREGP15514 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AREGP15514 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AREGP15514 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AREGP15514 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AREGP15514 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AREGP15514 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AREGP15514 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AREGP15514 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AREGP15514 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AREGP15514 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AREGP15514 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AREGP15514 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AREGP15514 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AREGP15514 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AREGP15514 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AREGP15514 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AREGP15514 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AREGP15514 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AREGP15514 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AREGP15514 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AREGP15514 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AREGP15514 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AREGP15514 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AREGP15514 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AREGP15514 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AREGP15514 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AREGP15514 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AREGP15514 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AREGP15514 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AREGP15514 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AREGP15514 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AREGP15514 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AREGP15514 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
AREGP15514 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AREGP15514 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AREGP15514 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AREGP15514 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AREGP15514 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AREGP15514 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AREGP15514 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AREGP15514 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AREGP15514 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AREGP15514 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AREGP15514 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AREGP15514 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AREGP15514 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AREGP15514 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AREGP15514 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AREGP15514 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AREGP15514 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AREGP15514 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AREGP15514 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AREGP15514 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
AREGP15514 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AREGP15514 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AREGP15514 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AREGP15514 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AREGP15514 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AREGP15514 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AREGP15514 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AREGP15514 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AREGP15514 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AREGP15514 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AREGP15514 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
AREGP15514 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AREGP15514 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AREGP15514 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AREGP15514 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AREGP15514 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AREGP15514 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AREGP15514 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AREGP15514 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AREGP15514 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AREGP15514 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AREGP15514 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AREGP15514 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AREGP15514 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AREGP15514 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AREGP15514 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms