Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LCP1P13796 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LCP1P13796 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LCP1P13796 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LCP1P13796 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LCP1P13796 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LCP1P13796 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LCP1P13796 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LCP1P13796 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LCP1P13796 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LCP1P13796 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LCP1P13796 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LCP1P13796 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LCP1P13796 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LCP1P13796 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LCP1P13796 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LCP1P13796 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
LCP1P13796 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LCP1P13796 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LCP1P13796 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LCP1P13796 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LCP1P13796 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LCP1P13796 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LCP1P13796 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LCP1P13796 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LCP1P13796 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LCP1P13796 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LCP1P13796 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LCP1P13796 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LCP1P13796 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LCP1P13796 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LCP1P13796 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LCP1P13796 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LCP1P13796 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LCP1P13796 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LCP1P13796 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LCP1P13796 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LCP1P13796 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LCP1P13796 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LCP1P13796 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LCP1P13796 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LCP1P13796 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LCP1P13796 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LCP1P13796 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LCP1P13796 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LCP1P13796 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LCP1P13796 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LCP1P13796 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LCP1P13796 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LCP1P13796 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LCP1P13796 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LCP1P13796 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LCP1P13796 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LCP1P13796 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LCP1P13796 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LCP1P13796 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
LCP1P13796 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LCP1P13796 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LCP1P13796 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LCP1P13796 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LCP1P13796 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
LCP1P13796 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LCP1P13796 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LCP1P13796 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LCP1P13796 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LCP1P13796 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LCP1P13796 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LCP1P13796 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LCP1P13796 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LCP1P13796 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LCP1P13796 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LCP1P13796 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LCP1P13796 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LCP1P13796 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LCP1P13796 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LCP1P13796 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LCP1P13796 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LCP1P13796 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LCP1P13796 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LCP1P13796 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LCP1P13796 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LCP1P13796 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LCP1P13796 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LCP1P13796 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LCP1P13796 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LCP1P13796 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LCP1P13796 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LCP1P13796 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LCP1P13796 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LCP1P13796 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LCP1P13796 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LCP1P13796 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LCP1P13796 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LCP1P13796 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LCP1P13796 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LCP1P13796 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LCP1P13796 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LCP1P13796 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LCP1P13796 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LCP1P13796 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms