Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IFITM1P13164 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IFITM1P13164 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IFITM1P13164 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFITM1P13164 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFITM1P13164 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFITM1P13164 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFITM1P13164 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFITM1P13164 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFITM1P13164 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFITM1P13164 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFITM1P13164 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFITM1P13164 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFITM1P13164 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFITM1P13164 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFITM1P13164 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFITM1P13164 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFITM1P13164 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFITM1P13164 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFITM1P13164 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFITM1P13164 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFITM1P13164 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFITM1P13164 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFITM1P13164 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFITM1P13164 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFITM1P13164 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFITM1P13164 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFITM1P13164 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFITM1P13164 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IFITM1P13164 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFITM1P13164 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFITM1P13164 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IFITM1P13164 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFITM1P13164 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFITM1P13164 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFITM1P13164 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFITM1P13164 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFITM1P13164 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFITM1P13164 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFITM1P13164 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
IFITM1P13164 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFITM1P13164 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFITM1P13164 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFITM1P13164 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFITM1P13164 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFITM1P13164 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFITM1P13164 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFITM1P13164 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFITM1P13164 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFITM1P13164 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFITM1P13164 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFITM1P13164 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFITM1P13164 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFITM1P13164 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFITM1P13164 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IFITM1P13164 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFITM1P13164 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFITM1P13164 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFITM1P13164 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFITM1P13164 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFITM1P13164 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFITM1P13164 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFITM1P13164 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFITM1P13164 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFITM1P13164 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFITM1P13164 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFITM1P13164 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFITM1P13164 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFITM1P13164 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFITM1P13164 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFITM1P13164 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFITM1P13164 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFITM1P13164 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFITM1P13164 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFITM1P13164 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFITM1P13164 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFITM1P13164 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFITM1P13164 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFITM1P13164 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFITM1P13164 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFITM1P13164 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFITM1P13164 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFITM1P13164 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFITM1P13164 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFITM1P13164 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFITM1P13164 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFITM1P13164 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFITM1P13164 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFITM1P13164 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFITM1P13164 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFITM1P13164 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFITM1P13164 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFITM1P13164 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFITM1P13164 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFITM1P13164 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFITM1P13164 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFITM1P13164 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFITM1P13164 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFITM1P13164 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IFITM1P13164 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms