Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFHP12036 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEFHP12036 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEFHP12036 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEFHP12036 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEFHP12036 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEFHP12036 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEFHP12036 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEFHP12036 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEFHP12036 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEFHP12036 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEFHP12036 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEFHP12036 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEFHP12036 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEFHP12036 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFHP12036 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFHP12036 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFHP12036 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFHP12036 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFHP12036 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFHP12036 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFHP12036 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEFHP12036 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NEFHP12036 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFHP12036 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFHP12036 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEFHP12036 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFHP12036 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFHP12036 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEFHP12036 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFHP12036 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFHP12036 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFHP12036 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEFHP12036 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEFHP12036 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEFHP12036 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEFHP12036 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEFHP12036 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NEFHP12036 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEFHP12036 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEFHP12036 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEFHP12036 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEFHP12036 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEFHP12036 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEFHP12036 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEFHP12036 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFHP12036 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFHP12036 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFHP12036 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEFHP12036 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEFHP12036 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEFHP12036 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEFHP12036 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEFHP12036 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEFHP12036 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEFHP12036 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NEFHP12036 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEFHP12036 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFHP12036 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFHP12036 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEFHP12036 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEFHP12036 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEFHP12036 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEFHP12036 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEFHP12036 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEFHP12036 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NEFHP12036 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEFHP12036 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEFHP12036 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEFHP12036 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEFHP12036 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEFHP12036 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEFHP12036 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEFHP12036 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFHP12036 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEFHP12036 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFHP12036 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEFHP12036 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEFHP12036 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEFHP12036 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NEFHP12036 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEFHP12036 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEFHP12036 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEFHP12036 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFHP12036 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEFHP12036 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEFHP12036 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEFHP12036 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEFHP12036 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEFHP12036 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEFHP12036 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEFHP12036 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEFHP12036 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEFHP12036 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFHP12036 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFHP12036 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFHP12036 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEFHP12036 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFHP12036 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFHP12036 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms