Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAMP11215 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAMP11215 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAMP11215 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAMP11215 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGAMP11215 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGAMP11215 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGAMP11215 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGAMP11215 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGAMP11215 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGAMP11215 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGAMP11215 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGAMP11215 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGAMP11215 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGAMP11215 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGAMP11215 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGAMP11215 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGAMP11215 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAMP11215 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAMP11215 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAMP11215 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGAMP11215 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGAMP11215 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGAMP11215 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGAMP11215 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGAMP11215 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGAMP11215 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAMP11215 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGAMP11215 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAMP11215 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAMP11215 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAMP11215 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGAMP11215 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGAMP11215 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGAMP11215 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGAMP11215 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGAMP11215 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGAMP11215 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGAMP11215 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGAMP11215 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGAMP11215 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGAMP11215 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGAMP11215 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGAMP11215 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGAMP11215 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAMP11215 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAMP11215 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAMP11215 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAMP11215 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAMP11215 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGAMP11215 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAMP11215 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAMP11215 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGAMP11215 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGAMP11215 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGAMP11215 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAMP11215 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAMP11215 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGAMP11215 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGAMP11215 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGAMP11215 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGAMP11215 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGAMP11215 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGAMP11215 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGAMP11215 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGAMP11215 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGAMP11215 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGAMP11215 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGAMP11215 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGAMP11215 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAMP11215 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAMP11215 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAMP11215 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGAMP11215 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGAMP11215 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAMP11215 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAMP11215 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAMP11215 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAMP11215 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGAMP11215 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAMP11215 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAMP11215 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAMP11215 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAMP11215 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGAMP11215 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAMP11215 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGAMP11215 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGAMP11215 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGAMP11215 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGAMP11215 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGAMP11215 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGAMP11215 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGAMP11215 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGAMP11215 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGAMP11215 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGAMP11215 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGAMP11215 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAMP11215 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGAMP11215 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGAMP11215 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms