Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM225BP0DP42 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM225BP0DP42 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM225BP0DP42 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM225BP0DP42 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM225BP0DP42 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM225BP0DP42 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM225BP0DP42 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM225BP0DP42 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM225BP0DP42 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM225BP0DP42 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM225BP0DP42 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM225BP0DP42 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM225BP0DP42 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM225BP0DP42 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM225BP0DP42 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM225BP0DP42 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM225BP0DP42 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM225BP0DP42 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM225BP0DP42 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM225BP0DP42 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM225BP0DP42 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM225BP0DP42 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM225BP0DP42 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM225BP0DP42 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM225BP0DP42 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM225BP0DP42 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM225BP0DP42 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM225BP0DP42 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM225BP0DP42 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM225BP0DP42 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM225BP0DP42 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM225BP0DP42 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM225BP0DP42 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM225BP0DP42 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM225BP0DP42 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM225BP0DP42 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM225BP0DP42 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM225BP0DP42 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM225BP0DP42 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM225BP0DP42 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM225BP0DP42 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM225BP0DP42 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM225BP0DP42 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM225BP0DP42 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM225BP0DP42 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM225BP0DP42 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM225BP0DP42 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM225BP0DP42 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM225BP0DP42 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM225BP0DP42 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM225BP0DP42 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM225BP0DP42 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM225BP0DP42 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM225BP0DP42 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM225BP0DP42 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM225BP0DP42 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM225BP0DP42 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM225BP0DP42 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM225BP0DP42 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM225BP0DP42 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM225BP0DP42 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM225BP0DP42 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM225BP0DP42 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM225BP0DP42 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM225BP0DP42 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM225BP0DP42 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM225BP0DP42 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM225BP0DP42 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM225BP0DP42 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM225BP0DP42 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM225BP0DP42 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM225BP0DP42 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM225BP0DP42 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM225BP0DP42 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM225BP0DP42 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM225BP0DP42 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM225BP0DP42 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM225BP0DP42 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM225BP0DP42 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM225BP0DP42 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM225BP0DP42 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM225BP0DP42 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM225BP0DP42 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM225BP0DP42 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM225BP0DP42 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM225BP0DP42 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM225BP0DP42 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM225BP0DP42 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM225BP0DP42 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM225BP0DP42 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM225BP0DP42 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM225BP0DP42 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM225BP0DP42 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM225BP0DP42 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM225BP0DP42 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM225BP0DP42 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM225BP0DP42 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM225BP0DP42 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM225BP0DP42 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms