Protein–RNA interactions for Protein: P0DMU3

FAM231A/C-like protein LOC102723383, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0DMU3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P0DMU3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
P0DMU3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P0DMU3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P0DMU3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P0DMU3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P0DMU3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P0DMU3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
P0DMU3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P0DMU3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
P0DMU3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
P0DMU3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
P0DMU3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P0DMU3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
P0DMU3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
P0DMU3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P0DMU3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P0DMU3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
P0DMU3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P0DMU3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P0DMU3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P0DMU3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P0DMU3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P0DMU3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
P0DMU3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
P0DMU3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P0DMU3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
P0DMU3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
P0DMU3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P0DMU3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P0DMU3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P0DMU3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
P0DMU3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
P0DMU3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
P0DMU3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
P0DMU3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
P0DMU3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
P0DMU3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
P0DMU3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
P0DMU3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
P0DMU3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
P0DMU3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
P0DMU3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
P0DMU3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
P0DMU3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
P0DMU3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
P0DMU3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
P0DMU3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
P0DMU3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
P0DMU3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
P0DMU3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
P0DMU3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
P0DMU3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
P0DMU3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
P0DMU3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
P0DMU3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
P0DMU3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
P0DMU3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
P0DMU3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
P0DMU3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
P0DMU3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
P0DMU3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
P0DMU3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
P0DMU3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
P0DMU3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
P0DMU3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
P0DMU3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
P0DMU3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
P0DMU3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
P0DMU3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
P0DMU3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
P0DMU3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
P0DMU3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
P0DMU3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
P0DMU3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
P0DMU3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
P0DMU3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
P0DMU3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
P0DMU3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
P0DMU3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
P0DMU3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
P0DMU3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
P0DMU3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
P0DMU3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
P0DMU3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
P0DMU3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
P0DMU3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
P0DMU3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
P0DMU3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
P0DMU3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
P0DMU3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
P0DMU3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
P0DMU3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
P0DMU3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
P0DMU3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
P0DMU3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
P0DMU3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
P0DMU3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
P0DMU3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
P0DMU3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms