Protein–RNA interactions for Protein: P0CG37

CFC1, Cryptic protein, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFC1P0CG37 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFC1P0CG37 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFC1P0CG37 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFC1P0CG37 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFC1P0CG37 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFC1P0CG37 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFC1P0CG37 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFC1P0CG37 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFC1P0CG37 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFC1P0CG37 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFC1P0CG37 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFC1P0CG37 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CFC1P0CG37 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CFC1P0CG37 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CFC1P0CG37 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CFC1P0CG37 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CFC1P0CG37 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CFC1P0CG37 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFC1P0CG37 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFC1P0CG37 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFC1P0CG37 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFC1P0CG37 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CFC1P0CG37 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CFC1P0CG37 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CFC1P0CG37 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CFC1P0CG37 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CFC1P0CG37 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CFC1P0CG37 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CFC1P0CG37 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CFC1P0CG37 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CFC1P0CG37 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CFC1P0CG37 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CFC1P0CG37 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CFC1P0CG37 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CFC1P0CG37 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CFC1P0CG37 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFC1P0CG37 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFC1P0CG37 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFC1P0CG37 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFC1P0CG37 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFC1P0CG37 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFC1P0CG37 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFC1P0CG37 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFC1P0CG37 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFC1P0CG37 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFC1P0CG37 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CFC1P0CG37 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CFC1P0CG37 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CFC1P0CG37 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFC1P0CG37 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFC1P0CG37 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFC1P0CG37 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFC1P0CG37 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFC1P0CG37 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFC1P0CG37 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFC1P0CG37 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFC1P0CG37 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CFC1P0CG37 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CFC1P0CG37 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CFC1P0CG37 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CFC1P0CG37 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CFC1P0CG37 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CFC1P0CG37 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CFC1P0CG37 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CFC1P0CG37 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CFC1P0CG37 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CFC1P0CG37 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CFC1P0CG37 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CFC1P0CG37 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFC1P0CG37 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFC1P0CG37 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFC1P0CG37 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFC1P0CG37 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFC1P0CG37 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFC1P0CG37 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFC1P0CG37 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFC1P0CG37 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFC1P0CG37 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFC1P0CG37 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFC1P0CG37 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFC1P0CG37 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFC1P0CG37 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFC1P0CG37 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFC1P0CG37 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CFC1P0CG37 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFC1P0CG37 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFC1P0CG37 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFC1P0CG37 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFC1P0CG37 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFC1P0CG37 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFC1P0CG37 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFC1P0CG37 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFC1P0CG37 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFC1P0CG37 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFC1P0CG37 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFC1P0CG37 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFC1P0CG37 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFC1P0CG37 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFC1P0CG37 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFC1P0CG37 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms