Protein–RNA interactions for Protein: P0CG36

CFC1B, Cryptic family protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFC1BP0CG36 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFC1BP0CG36 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFC1BP0CG36 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFC1BP0CG36 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFC1BP0CG36 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFC1BP0CG36 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFC1BP0CG36 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFC1BP0CG36 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFC1BP0CG36 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFC1BP0CG36 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFC1BP0CG36 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFC1BP0CG36 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CFC1BP0CG36 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CFC1BP0CG36 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CFC1BP0CG36 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CFC1BP0CG36 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CFC1BP0CG36 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CFC1BP0CG36 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFC1BP0CG36 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CFC1BP0CG36 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFC1BP0CG36 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFC1BP0CG36 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CFC1BP0CG36 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CFC1BP0CG36 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CFC1BP0CG36 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CFC1BP0CG36 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CFC1BP0CG36 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CFC1BP0CG36 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CFC1BP0CG36 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CFC1BP0CG36 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CFC1BP0CG36 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CFC1BP0CG36 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CFC1BP0CG36 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CFC1BP0CG36 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CFC1BP0CG36 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CFC1BP0CG36 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFC1BP0CG36 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFC1BP0CG36 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFC1BP0CG36 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFC1BP0CG36 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFC1BP0CG36 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFC1BP0CG36 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFC1BP0CG36 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFC1BP0CG36 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFC1BP0CG36 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFC1BP0CG36 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CFC1BP0CG36 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CFC1BP0CG36 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CFC1BP0CG36 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFC1BP0CG36 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFC1BP0CG36 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFC1BP0CG36 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFC1BP0CG36 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFC1BP0CG36 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFC1BP0CG36 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFC1BP0CG36 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CFC1BP0CG36 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CFC1BP0CG36 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CFC1BP0CG36 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CFC1BP0CG36 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CFC1BP0CG36 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CFC1BP0CG36 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CFC1BP0CG36 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CFC1BP0CG36 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CFC1BP0CG36 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CFC1BP0CG36 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CFC1BP0CG36 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CFC1BP0CG36 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CFC1BP0CG36 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFC1BP0CG36 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFC1BP0CG36 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFC1BP0CG36 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFC1BP0CG36 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFC1BP0CG36 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFC1BP0CG36 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFC1BP0CG36 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFC1BP0CG36 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFC1BP0CG36 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFC1BP0CG36 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFC1BP0CG36 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFC1BP0CG36 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFC1BP0CG36 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFC1BP0CG36 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFC1BP0CG36 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CFC1BP0CG36 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFC1BP0CG36 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFC1BP0CG36 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFC1BP0CG36 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFC1BP0CG36 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFC1BP0CG36 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFC1BP0CG36 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFC1BP0CG36 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFC1BP0CG36 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFC1BP0CG36 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFC1BP0CG36 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFC1BP0CG36 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFC1BP0CG36 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFC1BP0CG36 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFC1BP0CG36 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CFC1BP0CG36 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms