Protein–RNA interactions for Protein: P0C263

SBK2, Serine/threonine-protein kinase SBK2, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK2P0C263 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SBK2P0C263 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBK2P0C263 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBK2P0C263 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBK2P0C263 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBK2P0C263 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SBK2P0C263 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SBK2P0C263 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBK2P0C263 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBK2P0C263 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SBK2P0C263 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBK2P0C263 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBK2P0C263 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBK2P0C263 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBK2P0C263 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SBK2P0C263 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SBK2P0C263 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBK2P0C263 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBK2P0C263 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBK2P0C263 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBK2P0C263 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBK2P0C263 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBK2P0C263 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBK2P0C263 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SBK2P0C263 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SBK2P0C263 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SBK2P0C263 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SBK2P0C263 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SBK2P0C263 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SBK2P0C263 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SBK2P0C263 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SBK2P0C263 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SBK2P0C263 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SBK2P0C263 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SBK2P0C263 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SBK2P0C263 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SBK2P0C263 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SBK2P0C263 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SBK2P0C263 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SBK2P0C263 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SBK2P0C263 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SBK2P0C263 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SBK2P0C263 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBK2P0C263 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SBK2P0C263 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SBK2P0C263 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SBK2P0C263 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SBK2P0C263 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SBK2P0C263 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SBK2P0C263 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SBK2P0C263 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SBK2P0C263 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBK2P0C263 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBK2P0C263 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBK2P0C263 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBK2P0C263 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBK2P0C263 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SBK2P0C263 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SBK2P0C263 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SBK2P0C263 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SBK2P0C263 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SBK2P0C263 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SBK2P0C263 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SBK2P0C263 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SBK2P0C263 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SBK2P0C263 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SBK2P0C263 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SBK2P0C263 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SBK2P0C263 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SBK2P0C263 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SBK2P0C263 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SBK2P0C263 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SBK2P0C263 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SBK2P0C263 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SBK2P0C263 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK2P0C263 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK2P0C263 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBK2P0C263 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBK2P0C263 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBK2P0C263 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBK2P0C263 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBK2P0C263 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBK2P0C263 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBK2P0C263 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBK2P0C263 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBK2P0C263 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBK2P0C263 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBK2P0C263 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBK2P0C263 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SBK2P0C263 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SBK2P0C263 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SBK2P0C263 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SBK2P0C263 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SBK2P0C263 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SBK2P0C263 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SBK2P0C263 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SBK2P0C263 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SBK2P0C263 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBK2P0C263 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBK2P0C263 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms