Protein–RNA interactions for Protein: P09234

SNRPC, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPCP09234 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNRPCP09234 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNRPCP09234 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNRPCP09234 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNRPCP09234 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNRPCP09234 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNRPCP09234 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNRPCP09234 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPCP09234 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPCP09234 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPCP09234 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPCP09234 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPCP09234 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPCP09234 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPCP09234 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPCP09234 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPCP09234 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPCP09234 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPCP09234 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPCP09234 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPCP09234 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPCP09234 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPCP09234 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPCP09234 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPCP09234 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRPCP09234 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNRPCP09234 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPCP09234 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPCP09234 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPCP09234 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPCP09234 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPCP09234 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPCP09234 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPCP09234 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPCP09234 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPCP09234 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPCP09234 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPCP09234 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPCP09234 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPCP09234 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPCP09234 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPCP09234 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNRPCP09234 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPCP09234 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPCP09234 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPCP09234 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPCP09234 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPCP09234 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPCP09234 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPCP09234 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPCP09234 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNRPCP09234 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNRPCP09234 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPCP09234 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPCP09234 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPCP09234 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPCP09234 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPCP09234 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPCP09234 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPCP09234 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPCP09234 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPCP09234 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPCP09234 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNRPCP09234 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPCP09234 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPCP09234 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPCP09234 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPCP09234 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPCP09234 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPCP09234 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPCP09234 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPCP09234 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPCP09234 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPCP09234 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPCP09234 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPCP09234 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPCP09234 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPCP09234 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNRPCP09234 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNRPCP09234 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPCP09234 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPCP09234 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPCP09234 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPCP09234 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPCP09234 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPCP09234 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPCP09234 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPCP09234 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPCP09234 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPCP09234 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPCP09234 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPCP09234 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPCP09234 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNRPCP09234 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNRPCP09234 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNRPCP09234 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SNRPCP09234 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNRPCP09234 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNRPCP09234 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNRPCP09234 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms