Protein–RNA interactions for Protein: P08922

ROS1, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase ROS, humanhuman

Predictions only

Length 2,347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROS1P08922 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ROS1P08922 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ROS1P08922 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ROS1P08922 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ROS1P08922 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ROS1P08922 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ROS1P08922 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ROS1P08922 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ROS1P08922 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ROS1P08922 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ROS1P08922 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ROS1P08922 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ROS1P08922 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ROS1P08922 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ROS1P08922 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ROS1P08922 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ROS1P08922 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ROS1P08922 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ROS1P08922 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ROS1P08922 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ROS1P08922 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ROS1P08922 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ROS1P08922 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ROS1P08922 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ROS1P08922 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ROS1P08922 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ROS1P08922 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ROS1P08922 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ROS1P08922 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ROS1P08922 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ROS1P08922 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ROS1P08922 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ROS1P08922 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ROS1P08922 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ROS1P08922 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ROS1P08922 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ROS1P08922 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ROS1P08922 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ROS1P08922 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ROS1P08922 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ROS1P08922 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ROS1P08922 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ROS1P08922 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ROS1P08922 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ROS1P08922 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ROS1P08922 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ROS1P08922 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ROS1P08922 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ROS1P08922 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ROS1P08922 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ROS1P08922 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ROS1P08922 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ROS1P08922 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ROS1P08922 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ROS1P08922 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ROS1P08922 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ROS1P08922 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ROS1P08922 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ROS1P08922 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ROS1P08922 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ROS1P08922 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ROS1P08922 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ROS1P08922 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ROS1P08922 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ROS1P08922 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ROS1P08922 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ROS1P08922 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ROS1P08922 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ROS1P08922 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ROS1P08922 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ROS1P08922 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ROS1P08922 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ROS1P08922 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ROS1P08922 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ROS1P08922 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ROS1P08922 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ROS1P08922 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ROS1P08922 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ROS1P08922 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ROS1P08922 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ROS1P08922 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ROS1P08922 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ROS1P08922 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ROS1P08922 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ROS1P08922 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ROS1P08922 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ROS1P08922 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ROS1P08922 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ROS1P08922 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ROS1P08922 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ROS1P08922 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ROS1P08922 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ROS1P08922 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ROS1P08922 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ROS1P08922 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ROS1P08922 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ROS1P08922 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ROS1P08922 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ROS1P08922 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ROS1P08922 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms