Protein–RNA interactions for Protein: P08908

HTR1A, 5-hydroxytryptamine receptor 1A, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1AP08908 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTR1AP08908 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HTR1AP08908 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTR1AP08908 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTR1AP08908 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTR1AP08908 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTR1AP08908 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTR1AP08908 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTR1AP08908 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTR1AP08908 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTR1AP08908 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTR1AP08908 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTR1AP08908 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTR1AP08908 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTR1AP08908 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTR1AP08908 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTR1AP08908 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTR1AP08908 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTR1AP08908 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTR1AP08908 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTR1AP08908 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTR1AP08908 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTR1AP08908 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTR1AP08908 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTR1AP08908 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTR1AP08908 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTR1AP08908 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTR1AP08908 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTR1AP08908 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTR1AP08908 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTR1AP08908 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTR1AP08908 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTR1AP08908 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTR1AP08908 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HTR1AP08908 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTR1AP08908 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTR1AP08908 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTR1AP08908 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTR1AP08908 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTR1AP08908 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTR1AP08908 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTR1AP08908 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTR1AP08908 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTR1AP08908 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTR1AP08908 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTR1AP08908 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTR1AP08908 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTR1AP08908 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTR1AP08908 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTR1AP08908 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTR1AP08908 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTR1AP08908 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTR1AP08908 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HTR1AP08908 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTR1AP08908 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTR1AP08908 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTR1AP08908 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTR1AP08908 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTR1AP08908 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HTR1AP08908 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTR1AP08908 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTR1AP08908 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTR1AP08908 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTR1AP08908 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTR1AP08908 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTR1AP08908 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HTR1AP08908 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HTR1AP08908 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTR1AP08908 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTR1AP08908 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HTR1AP08908 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTR1AP08908 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTR1AP08908 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTR1AP08908 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTR1AP08908 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTR1AP08908 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HTR1AP08908 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HTR1AP08908 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTR1AP08908 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTR1AP08908 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTR1AP08908 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTR1AP08908 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTR1AP08908 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTR1AP08908 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTR1AP08908 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HTR1AP08908 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTR1AP08908 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTR1AP08908 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTR1AP08908 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTR1AP08908 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTR1AP08908 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTR1AP08908 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTR1AP08908 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTR1AP08908 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTR1AP08908 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTR1AP08908 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTR1AP08908 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTR1AP08908 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTR1AP08908 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTR1AP08908 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms