Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GJB1P08034 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GJB1P08034 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GJB1P08034 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GJB1P08034 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GJB1P08034 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GJB1P08034 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GJB1P08034 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
GJB1P08034 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GJB1P08034 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GJB1P08034 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GJB1P08034 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GJB1P08034 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GJB1P08034 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GJB1P08034 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GJB1P08034 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GJB1P08034 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GJB1P08034 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GJB1P08034 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GJB1P08034 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
GJB1P08034 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
GJB1P08034 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
GJB1P08034 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GJB1P08034 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
GJB1P08034 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
GJB1P08034 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
GJB1P08034 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GJB1P08034 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GJB1P08034 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GJB1P08034 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
GJB1P08034 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
GJB1P08034 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
GJB1P08034 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
GJB1P08034 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GJB1P08034 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GJB1P08034 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
GJB1P08034 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GJB1P08034 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GJB1P08034 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
GJB1P08034 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GJB1P08034 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GJB1P08034 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GJB1P08034 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GJB1P08034 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GJB1P08034 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GJB1P08034 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GJB1P08034 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GJB1P08034 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
GJB1P08034 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GJB1P08034 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GJB1P08034 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GJB1P08034 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
GJB1P08034 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GJB1P08034 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GJB1P08034 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GJB1P08034 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GJB1P08034 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
GJB1P08034 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GJB1P08034 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GJB1P08034 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GJB1P08034 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GJB1P08034 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
GJB1P08034 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
GJB1P08034 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
GJB1P08034 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GJB1P08034 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GJB1P08034 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GJB1P08034 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GJB1P08034 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GJB1P08034 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GJB1P08034 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GJB1P08034 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GJB1P08034 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GJB1P08034 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GJB1P08034 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GJB1P08034 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GJB1P08034 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GJB1P08034 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GJB1P08034 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GJB1P08034 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GJB1P08034 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GJB1P08034 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GJB1P08034 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GJB1P08034 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GJB1P08034 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GJB1P08034 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GJB1P08034 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GJB1P08034 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GJB1P08034 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
GJB1P08034 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GJB1P08034 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GJB1P08034 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GJB1P08034 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GJB1P08034 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GJB1P08034 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GJB1P08034 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GJB1P08034 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GJB1P08034 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GJB1P08034 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GJB1P08034 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms