Protein–RNA interactions for Protein: P06307

CCK, Cholecystokinin, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKP06307 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKP06307 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKP06307 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKP06307 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKP06307 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKP06307 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKP06307 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKP06307 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCKP06307 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCKP06307 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCKP06307 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCKP06307 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCKP06307 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKP06307 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKP06307 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKP06307 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKP06307 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKP06307 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKP06307 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKP06307 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKP06307 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKP06307 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKP06307 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKP06307 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKP06307 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCKP06307 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKP06307 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKP06307 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCKP06307 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCKP06307 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCKP06307 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCKP06307 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCKP06307 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKP06307 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKP06307 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKP06307 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKP06307 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKP06307 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKP06307 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKP06307 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCKP06307 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKP06307 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKP06307 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKP06307 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKP06307 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKP06307 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCKP06307 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCKP06307 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCKP06307 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCKP06307 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKP06307 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKP06307 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKP06307 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKP06307 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKP06307 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKP06307 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKP06307 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKP06307 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKP06307 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKP06307 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKP06307 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKP06307 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKP06307 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKP06307 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKP06307 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKP06307 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKP06307 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKP06307 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKP06307 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKP06307 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKP06307 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKP06307 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKP06307 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKP06307 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKP06307 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKP06307 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKP06307 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKP06307 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKP06307 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKP06307 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKP06307 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKP06307 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKP06307 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKP06307 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKP06307 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKP06307 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKP06307 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKP06307 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKP06307 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKP06307 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKP06307 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKP06307 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKP06307 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKP06307 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKP06307 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKP06307 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKP06307 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKP06307 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKP06307 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKP06307 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms