Protein–RNA interactions for Protein: P05013

IFNA6, Interferon alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA6P05013 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNA6P05013 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNA6P05013 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNA6P05013 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNA6P05013 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNA6P05013 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNA6P05013 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNA6P05013 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNA6P05013 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNA6P05013 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFNA6P05013 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNA6P05013 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNA6P05013 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNA6P05013 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNA6P05013 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNA6P05013 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNA6P05013 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNA6P05013 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNA6P05013 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNA6P05013 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNA6P05013 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNA6P05013 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNA6P05013 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNA6P05013 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFNA6P05013 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFNA6P05013 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNA6P05013 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNA6P05013 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNA6P05013 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNA6P05013 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNA6P05013 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNA6P05013 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNA6P05013 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNA6P05013 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFNA6P05013 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNA6P05013 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNA6P05013 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNA6P05013 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNA6P05013 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNA6P05013 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNA6P05013 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNA6P05013 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNA6P05013 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNA6P05013 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNA6P05013 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNA6P05013 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IFNA6P05013 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNA6P05013 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNA6P05013 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNA6P05013 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNA6P05013 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNA6P05013 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNA6P05013 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNA6P05013 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNA6P05013 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNA6P05013 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNA6P05013 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNA6P05013 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNA6P05013 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNA6P05013 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNA6P05013 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNA6P05013 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNA6P05013 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNA6P05013 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNA6P05013 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNA6P05013 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNA6P05013 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNA6P05013 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNA6P05013 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNA6P05013 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNA6P05013 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNA6P05013 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNA6P05013 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNA6P05013 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNA6P05013 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNA6P05013 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNA6P05013 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNA6P05013 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNA6P05013 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNA6P05013 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNA6P05013 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNA6P05013 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNA6P05013 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNA6P05013 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNA6P05013 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNA6P05013 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNA6P05013 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFNA6P05013 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFNA6P05013 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNA6P05013 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNA6P05013 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNA6P05013 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNA6P05013 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNA6P05013 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNA6P05013 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNA6P05013 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNA6P05013 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNA6P05013 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNA6P05013 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNA6P05013 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms