Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOA1P02647 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOA1P02647 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOA1P02647 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOA1P02647 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOA1P02647 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOA1P02647 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOA1P02647 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOA1P02647 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOA1P02647 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOA1P02647 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOA1P02647 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOA1P02647 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOA1P02647 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOA1P02647 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOA1P02647 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOA1P02647 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOA1P02647 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOA1P02647 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOA1P02647 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
APOA1P02647 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOA1P02647 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOA1P02647 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA1P02647 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA1P02647 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA1P02647 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOA1P02647 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOA1P02647 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
APOA1P02647 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
APOA1P02647 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOA1P02647 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOA1P02647 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOA1P02647 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOA1P02647 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOA1P02647 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOA1P02647 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOA1P02647 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOA1P02647 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOA1P02647 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOA1P02647 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOA1P02647 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOA1P02647 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOA1P02647 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOA1P02647 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOA1P02647 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOA1P02647 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOA1P02647 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOA1P02647 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOA1P02647 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
APOA1P02647 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOA1P02647 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOA1P02647 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOA1P02647 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOA1P02647 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOA1P02647 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOA1P02647 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOA1P02647 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOA1P02647 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOA1P02647 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOA1P02647 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOA1P02647 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOA1P02647 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOA1P02647 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
APOA1P02647 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOA1P02647 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOA1P02647 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOA1P02647 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOA1P02647 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOA1P02647 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOA1P02647 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOA1P02647 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOA1P02647 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOA1P02647 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOA1P02647 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOA1P02647 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOA1P02647 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOA1P02647 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOA1P02647 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOA1P02647 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOA1P02647 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOA1P02647 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOA1P02647 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOA1P02647 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOA1P02647 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOA1P02647 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOA1P02647 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOA1P02647 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOA1P02647 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOA1P02647 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOA1P02647 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOA1P02647 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOA1P02647 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOA1P02647 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOA1P02647 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOA1P02647 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA1P02647 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA1P02647 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA1P02647 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA1P02647 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOA1P02647 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms