Protein–RNA interactions for Protein: P01597

IGKV1-39, Immunoglobulin kappa variable 1-39, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-39P01597 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV1-39P01597 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGKV1-39P01597 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGKV1-39P01597 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGKV1-39P01597 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IGKV1-39P01597 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IGKV1-39P01597 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGKV1-39P01597 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGKV1-39P01597 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGKV1-39P01597 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGKV1-39P01597 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGKV1-39P01597 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGKV1-39P01597 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGKV1-39P01597 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGKV1-39P01597 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGKV1-39P01597 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGKV1-39P01597 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGKV1-39P01597 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGKV1-39P01597 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGKV1-39P01597 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGKV1-39P01597 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGKV1-39P01597 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGKV1-39P01597 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGKV1-39P01597 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGKV1-39P01597 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGKV1-39P01597 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGKV1-39P01597 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IGKV1-39P01597 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGKV1-39P01597 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGKV1-39P01597 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGKV1-39P01597 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGKV1-39P01597 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGKV1-39P01597 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGKV1-39P01597 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGKV1-39P01597 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGKV1-39P01597 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGKV1-39P01597 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGKV1-39P01597 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV1-39P01597 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV1-39P01597 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGKV1-39P01597 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGKV1-39P01597 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGKV1-39P01597 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV1-39P01597 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IGKV1-39P01597 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGKV1-39P01597 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGKV1-39P01597 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGKV1-39P01597 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGKV1-39P01597 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGKV1-39P01597 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGKV1-39P01597 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGKV1-39P01597 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGKV1-39P01597 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGKV1-39P01597 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGKV1-39P01597 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGKV1-39P01597 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGKV1-39P01597 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGKV1-39P01597 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV1-39P01597 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV1-39P01597 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGKV1-39P01597 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGKV1-39P01597 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGKV1-39P01597 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGKV1-39P01597 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGKV1-39P01597 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGKV1-39P01597 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGKV1-39P01597 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGKV1-39P01597 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV1-39P01597 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV1-39P01597 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGKV1-39P01597 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGKV1-39P01597 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGKV1-39P01597 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IGKV1-39P01597 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGKV1-39P01597 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGKV1-39P01597 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGKV1-39P01597 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IGKV1-39P01597 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGKV1-39P01597 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGKV1-39P01597 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGKV1-39P01597 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGKV1-39P01597 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGKV1-39P01597 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGKV1-39P01597 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGKV1-39P01597 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGKV1-39P01597 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGKV1-39P01597 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGKV1-39P01597 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGKV1-39P01597 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGKV1-39P01597 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV1-39P01597 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGKV1-39P01597 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGKV1-39P01597 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGKV1-39P01597 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGKV1-39P01597 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV1-39P01597 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV1-39P01597 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV1-39P01597 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV1-39P01597 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV1-39P01597 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms