Protein–RNA interactions for Protein: P00450

CP, Ceruloplasmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPP00450 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPP00450 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPP00450 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPP00450 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPP00450 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CPP00450 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPP00450 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPP00450 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPP00450 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPP00450 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPP00450 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPP00450 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPP00450 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPP00450 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPP00450 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPP00450 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPP00450 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPP00450 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPP00450 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPP00450 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CPP00450 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CPP00450 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CPP00450 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPP00450 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPP00450 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPP00450 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPP00450 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CPP00450 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CPP00450 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CPP00450 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CPP00450 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CPP00450 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CPP00450 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPP00450 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPP00450 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPP00450 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CPP00450 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPP00450 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CPP00450 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CPP00450 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CPP00450 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CPP00450 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CPP00450 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPP00450 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPP00450 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPP00450 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPP00450 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPP00450 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPP00450 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPP00450 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPP00450 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPP00450 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPP00450 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPP00450 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPP00450 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPP00450 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPP00450 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPP00450 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPP00450 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CPP00450 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CPP00450 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPP00450 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPP00450 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPP00450 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPP00450 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CPP00450 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CPP00450 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CPP00450 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CPP00450 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPP00450 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPP00450 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPP00450 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPP00450 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPP00450 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPP00450 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPP00450 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPP00450 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPP00450 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPP00450 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPP00450 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPP00450 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPP00450 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPP00450 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPP00450 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPP00450 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPP00450 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPP00450 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPP00450 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPP00450 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPP00450 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPP00450 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPP00450 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPP00450 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CPP00450 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPP00450 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPP00450 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPP00450 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPP00450 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPP00450 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPP00450 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms