Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP3BO95985 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP3BO95985 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP3BO95985 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP3BO95985 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP3BO95985 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOP3BO95985 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOP3BO95985 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOP3BO95985 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOP3BO95985 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOP3BO95985 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TOP3BO95985 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOP3BO95985 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP3BO95985 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOP3BO95985 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOP3BO95985 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOP3BO95985 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TOP3BO95985 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TOP3BO95985 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOP3BO95985 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOP3BO95985 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOP3BO95985 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP3BO95985 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP3BO95985 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP3BO95985 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP3BO95985 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP3BO95985 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP3BO95985 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TOP3BO95985 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOP3BO95985 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOP3BO95985 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOP3BO95985 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOP3BO95985 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOP3BO95985 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOP3BO95985 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOP3BO95985 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOP3BO95985 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOP3BO95985 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOP3BO95985 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOP3BO95985 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOP3BO95985 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOP3BO95985 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOP3BO95985 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOP3BO95985 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOP3BO95985 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOP3BO95985 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP3BO95985 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP3BO95985 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP3BO95985 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP3BO95985 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP3BO95985 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP3BO95985 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP3BO95985 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOP3BO95985 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOP3BO95985 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOP3BO95985 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP3BO95985 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP3BO95985 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP3BO95985 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP3BO95985 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOP3BO95985 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOP3BO95985 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TOP3BO95985 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TOP3BO95985 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP3BO95985 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP3BO95985 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP3BO95985 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOP3BO95985 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOP3BO95985 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOP3BO95985 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOP3BO95985 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP3BO95985 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP3BO95985 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP3BO95985 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP3BO95985 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP3BO95985 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOP3BO95985 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOP3BO95985 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOP3BO95985 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP3BO95985 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP3BO95985 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP3BO95985 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP3BO95985 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP3BO95985 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP3BO95985 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP3BO95985 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP3BO95985 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP3BO95985 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP3BO95985 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOP3BO95985 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP3BO95985 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP3BO95985 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP3BO95985 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP3BO95985 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TOP3BO95985 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP3BO95985 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP3BO95985 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP3BO95985 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP3BO95985 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP3BO95985 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms