Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA4FO95754 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA4FO95754 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA4FO95754 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA4FO95754 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA4FO95754 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA4FO95754 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SEMA4FO95754 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SEMA4FO95754 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SEMA4FO95754 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEMA4FO95754 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEMA4FO95754 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEMA4FO95754 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEMA4FO95754 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEMA4FO95754 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEMA4FO95754 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SEMA4FO95754 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEMA4FO95754 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA4FO95754 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA4FO95754 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEMA4FO95754 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEMA4FO95754 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA4FO95754 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA4FO95754 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA4FO95754 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA4FO95754 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA4FO95754 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEMA4FO95754 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA4FO95754 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEMA4FO95754 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA4FO95754 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA4FO95754 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA4FO95754 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA4FO95754 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA4FO95754 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA4FO95754 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEMA4FO95754 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEMA4FO95754 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEMA4FO95754 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEMA4FO95754 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEMA4FO95754 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA4FO95754 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA4FO95754 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA4FO95754 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA4FO95754 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA4FO95754 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEMA4FO95754 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEMA4FO95754 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEMA4FO95754 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEMA4FO95754 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEMA4FO95754 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEMA4FO95754 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEMA4FO95754 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA4FO95754 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA4FO95754 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA4FO95754 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA4FO95754 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEMA4FO95754 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA4FO95754 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA4FO95754 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA4FO95754 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA4FO95754 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA4FO95754 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SEMA4FO95754 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA4FO95754 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA4FO95754 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEMA4FO95754 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA4FO95754 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA4FO95754 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEMA4FO95754 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEMA4FO95754 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SEMA4FO95754 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMA4FO95754 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMA4FO95754 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMA4FO95754 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMA4FO95754 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMA4FO95754 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMA4FO95754 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEMA4FO95754 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SEMA4FO95754 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA4FO95754 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA4FO95754 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SEMA4FO95754 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEMA4FO95754 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEMA4FO95754 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SEMA4FO95754 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA4FO95754 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA4FO95754 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEMA4FO95754 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEMA4FO95754 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEMA4FO95754 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA4FO95754 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA4FO95754 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SEMA4FO95754 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA4FO95754 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA4FO95754 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEMA4FO95754 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEMA4FO95754 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEMA4FO95754 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEMA4FO95754 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms