Protein–RNA interactions for Protein: O95274

LYPD3, Ly6/PLAUR domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD3O95274 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LYPD3O95274 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LYPD3O95274 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LYPD3O95274 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LYPD3O95274 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LYPD3O95274 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LYPD3O95274 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LYPD3O95274 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LYPD3O95274 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LYPD3O95274 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LYPD3O95274 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LYPD3O95274 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LYPD3O95274 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LYPD3O95274 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LYPD3O95274 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LYPD3O95274 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LYPD3O95274 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LYPD3O95274 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LYPD3O95274 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LYPD3O95274 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LYPD3O95274 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LYPD3O95274 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LYPD3O95274 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LYPD3O95274 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LYPD3O95274 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LYPD3O95274 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LYPD3O95274 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LYPD3O95274 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LYPD3O95274 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LYPD3O95274 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LYPD3O95274 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LYPD3O95274 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LYPD3O95274 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LYPD3O95274 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LYPD3O95274 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LYPD3O95274 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LYPD3O95274 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LYPD3O95274 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LYPD3O95274 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LYPD3O95274 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LYPD3O95274 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LYPD3O95274 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LYPD3O95274 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LYPD3O95274 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LYPD3O95274 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LYPD3O95274 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LYPD3O95274 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LYPD3O95274 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LYPD3O95274 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LYPD3O95274 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LYPD3O95274 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LYPD3O95274 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LYPD3O95274 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LYPD3O95274 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LYPD3O95274 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LYPD3O95274 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LYPD3O95274 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LYPD3O95274 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LYPD3O95274 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LYPD3O95274 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LYPD3O95274 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LYPD3O95274 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LYPD3O95274 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LYPD3O95274 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LYPD3O95274 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LYPD3O95274 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LYPD3O95274 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LYPD3O95274 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LYPD3O95274 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LYPD3O95274 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LYPD3O95274 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LYPD3O95274 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LYPD3O95274 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LYPD3O95274 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LYPD3O95274 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LYPD3O95274 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LYPD3O95274 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LYPD3O95274 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LYPD3O95274 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LYPD3O95274 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LYPD3O95274 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LYPD3O95274 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LYPD3O95274 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LYPD3O95274 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LYPD3O95274 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LYPD3O95274 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LYPD3O95274 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LYPD3O95274 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LYPD3O95274 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LYPD3O95274 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LYPD3O95274 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LYPD3O95274 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LYPD3O95274 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LYPD3O95274 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LYPD3O95274 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LYPD3O95274 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LYPD3O95274 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LYPD3O95274 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LYPD3O95274 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LYPD3O95274 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms