Protein–RNA interactions for Protein: O95149

SNUPN, Snurportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNUPNO95149 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNUPNO95149 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNUPNO95149 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNUPNO95149 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNUPNO95149 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNUPNO95149 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNUPNO95149 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNUPNO95149 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNUPNO95149 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNUPNO95149 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNUPNO95149 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNUPNO95149 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNUPNO95149 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNUPNO95149 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNUPNO95149 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNUPNO95149 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNUPNO95149 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNUPNO95149 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNUPNO95149 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNUPNO95149 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNUPNO95149 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNUPNO95149 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNUPNO95149 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNUPNO95149 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNUPNO95149 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNUPNO95149 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNUPNO95149 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNUPNO95149 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNUPNO95149 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNUPNO95149 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNUPNO95149 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNUPNO95149 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNUPNO95149 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNUPNO95149 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNUPNO95149 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNUPNO95149 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNUPNO95149 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNUPNO95149 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNUPNO95149 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SNUPNO95149 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNUPNO95149 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNUPNO95149 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNUPNO95149 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNUPNO95149 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNUPNO95149 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNUPNO95149 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNUPNO95149 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNUPNO95149 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNUPNO95149 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNUPNO95149 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNUPNO95149 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNUPNO95149 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNUPNO95149 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNUPNO95149 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNUPNO95149 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNUPNO95149 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNUPNO95149 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNUPNO95149 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNUPNO95149 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNUPNO95149 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNUPNO95149 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNUPNO95149 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNUPNO95149 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNUPNO95149 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNUPNO95149 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNUPNO95149 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNUPNO95149 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNUPNO95149 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNUPNO95149 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNUPNO95149 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SNUPNO95149 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNUPNO95149 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNUPNO95149 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNUPNO95149 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNUPNO95149 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNUPNO95149 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNUPNO95149 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNUPNO95149 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNUPNO95149 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNUPNO95149 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNUPNO95149 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNUPNO95149 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SNUPNO95149 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNUPNO95149 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNUPNO95149 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNUPNO95149 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNUPNO95149 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNUPNO95149 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNUPNO95149 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNUPNO95149 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNUPNO95149 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNUPNO95149 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNUPNO95149 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SNUPNO95149 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SNUPNO95149 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNUPNO95149 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNUPNO95149 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNUPNO95149 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNUPNO95149 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNUPNO95149 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms