Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMCC1O94876 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMCC1O94876 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMCC1O94876 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMCC1O94876 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMCC1O94876 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TMCC1O94876 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMCC1O94876 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMCC1O94876 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMCC1O94876 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMCC1O94876 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMCC1O94876 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMCC1O94876 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMCC1O94876 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMCC1O94876 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMCC1O94876 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMCC1O94876 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMCC1O94876 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMCC1O94876 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMCC1O94876 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMCC1O94876 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMCC1O94876 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMCC1O94876 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMCC1O94876 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMCC1O94876 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMCC1O94876 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TMCC1O94876 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMCC1O94876 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMCC1O94876 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMCC1O94876 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMCC1O94876 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMCC1O94876 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMCC1O94876 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMCC1O94876 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMCC1O94876 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMCC1O94876 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMCC1O94876 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMCC1O94876 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMCC1O94876 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMCC1O94876 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMCC1O94876 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMCC1O94876 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMCC1O94876 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMCC1O94876 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMCC1O94876 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMCC1O94876 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMCC1O94876 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMCC1O94876 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMCC1O94876 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMCC1O94876 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMCC1O94876 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMCC1O94876 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMCC1O94876 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMCC1O94876 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TMCC1O94876 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TMCC1O94876 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMCC1O94876 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TMCC1O94876 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMCC1O94876 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMCC1O94876 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMCC1O94876 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMCC1O94876 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMCC1O94876 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMCC1O94876 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMCC1O94876 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMCC1O94876 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMCC1O94876 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMCC1O94876 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMCC1O94876 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMCC1O94876 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMCC1O94876 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMCC1O94876 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMCC1O94876 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMCC1O94876 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMCC1O94876 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMCC1O94876 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMCC1O94876 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMCC1O94876 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMCC1O94876 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMCC1O94876 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMCC1O94876 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMCC1O94876 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMCC1O94876 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMCC1O94876 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMCC1O94876 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMCC1O94876 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMCC1O94876 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMCC1O94876 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMCC1O94876 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMCC1O94876 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMCC1O94876 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMCC1O94876 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMCC1O94876 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMCC1O94876 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TMCC1O94876 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMCC1O94876 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMCC1O94876 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TMCC1O94876 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMCC1O94876 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TMCC1O94876 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms