Protein–RNA interactions for Protein: O94782

USP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1O94782 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP1O94782 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP1O94782 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP1O94782 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP1O94782 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP1O94782 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP1O94782 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP1O94782 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP1O94782 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP1O94782 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP1O94782 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USP1O94782 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP1O94782 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP1O94782 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
USP1O94782 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP1O94782 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP1O94782 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP1O94782 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP1O94782 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP1O94782 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP1O94782 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP1O94782 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP1O94782 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP1O94782 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP1O94782 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP1O94782 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP1O94782 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP1O94782 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP1O94782 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP1O94782 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP1O94782 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP1O94782 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP1O94782 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP1O94782 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP1O94782 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP1O94782 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP1O94782 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
USP1O94782 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP1O94782 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP1O94782 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP1O94782 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP1O94782 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP1O94782 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP1O94782 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP1O94782 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
USP1O94782 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP1O94782 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP1O94782 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP1O94782 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP1O94782 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP1O94782 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP1O94782 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP1O94782 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP1O94782 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP1O94782 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP1O94782 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP1O94782 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP1O94782 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP1O94782 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP1O94782 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP1O94782 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP1O94782 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP1O94782 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP1O94782 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP1O94782 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP1O94782 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
USP1O94782 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP1O94782 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
USP1O94782 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP1O94782 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP1O94782 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP1O94782 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP1O94782 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP1O94782 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP1O94782 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP1O94782 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP1O94782 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP1O94782 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP1O94782 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP1O94782 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP1O94782 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP1O94782 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP1O94782 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP1O94782 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP1O94782 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP1O94782 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP1O94782 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP1O94782 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP1O94782 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP1O94782 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP1O94782 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP1O94782 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP1O94782 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP1O94782 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP1O94782 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP1O94782 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP1O94782 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP1O94782 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP1O94782 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP1O94782 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms