Protein–RNA interactions for Protein: O75971

SNAPC5, snRNA-activating protein complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC5O75971 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAPC5O75971 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAPC5O75971 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAPC5O75971 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAPC5O75971 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAPC5O75971 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAPC5O75971 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAPC5O75971 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAPC5O75971 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAPC5O75971 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAPC5O75971 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAPC5O75971 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNAPC5O75971 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAPC5O75971 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAPC5O75971 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAPC5O75971 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAPC5O75971 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAPC5O75971 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAPC5O75971 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAPC5O75971 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNAPC5O75971 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNAPC5O75971 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAPC5O75971 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAPC5O75971 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAPC5O75971 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAPC5O75971 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAPC5O75971 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAPC5O75971 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAPC5O75971 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAPC5O75971 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAPC5O75971 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAPC5O75971 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAPC5O75971 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAPC5O75971 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAPC5O75971 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAPC5O75971 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAPC5O75971 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAPC5O75971 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAPC5O75971 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAPC5O75971 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAPC5O75971 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAPC5O75971 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAPC5O75971 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAPC5O75971 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAPC5O75971 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAPC5O75971 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAPC5O75971 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAPC5O75971 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAPC5O75971 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAPC5O75971 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAPC5O75971 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAPC5O75971 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAPC5O75971 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAPC5O75971 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAPC5O75971 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAPC5O75971 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAPC5O75971 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAPC5O75971 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAPC5O75971 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAPC5O75971 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAPC5O75971 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAPC5O75971 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAPC5O75971 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAPC5O75971 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAPC5O75971 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAPC5O75971 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAPC5O75971 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAPC5O75971 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAPC5O75971 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAPC5O75971 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAPC5O75971 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAPC5O75971 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAPC5O75971 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAPC5O75971 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAPC5O75971 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAPC5O75971 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAPC5O75971 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAPC5O75971 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAPC5O75971 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAPC5O75971 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAPC5O75971 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAPC5O75971 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAPC5O75971 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAPC5O75971 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAPC5O75971 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAPC5O75971 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAPC5O75971 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAPC5O75971 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SNAPC5O75971 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAPC5O75971 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAPC5O75971 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAPC5O75971 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAPC5O75971 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAPC5O75971 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAPC5O75971 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAPC5O75971 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAPC5O75971 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAPC5O75971 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAPC5O75971 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAPC5O75971 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms