Protein–RNA interactions for Protein: O75493

CA11, Carbonic anhydrase-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA11O75493 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CA11O75493 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CA11O75493 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CA11O75493 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CA11O75493 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CA11O75493 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CA11O75493 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CA11O75493 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CA11O75493 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CA11O75493 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CA11O75493 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CA11O75493 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CA11O75493 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CA11O75493 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CA11O75493 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CA11O75493 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CA11O75493 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CA11O75493 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CA11O75493 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CA11O75493 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CA11O75493 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CA11O75493 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CA11O75493 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CA11O75493 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CA11O75493 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CA11O75493 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CA11O75493 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CA11O75493 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CA11O75493 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CA11O75493 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CA11O75493 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CA11O75493 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CA11O75493 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA11O75493 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CA11O75493 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CA11O75493 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CA11O75493 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CA11O75493 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CA11O75493 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CA11O75493 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CA11O75493 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CA11O75493 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CA11O75493 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CA11O75493 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CA11O75493 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA11O75493 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA11O75493 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA11O75493 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA11O75493 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CA11O75493 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CA11O75493 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CA11O75493 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA11O75493 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA11O75493 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA11O75493 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA11O75493 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CA11O75493 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CA11O75493 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CA11O75493 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CA11O75493 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CA11O75493 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CA11O75493 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA11O75493 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA11O75493 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CA11O75493 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CA11O75493 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CA11O75493 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CA11O75493 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CA11O75493 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA11O75493 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CA11O75493 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CA11O75493 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CA11O75493 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CA11O75493 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CA11O75493 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CA11O75493 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CA11O75493 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CA11O75493 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CA11O75493 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CA11O75493 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA11O75493 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CA11O75493 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA11O75493 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA11O75493 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA11O75493 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA11O75493 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA11O75493 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA11O75493 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA11O75493 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA11O75493 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA11O75493 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA11O75493 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA11O75493 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA11O75493 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CA11O75493 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA11O75493 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CA11O75493 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CA11O75493 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CA11O75493 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA11O75493 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms