Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RNF40O75150 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF40O75150 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF40O75150 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF40O75150 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF40O75150 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF40O75150 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RNF40O75150 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF40O75150 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF40O75150 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF40O75150 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF40O75150 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF40O75150 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF40O75150 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF40O75150 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF40O75150 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RNF40O75150 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RNF40O75150 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RNF40O75150 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RNF40O75150 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RNF40O75150 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RNF40O75150 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RNF40O75150 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF40O75150 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RNF40O75150 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF40O75150 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF40O75150 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF40O75150 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF40O75150 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF40O75150 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF40O75150 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF40O75150 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF40O75150 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF40O75150 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF40O75150 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF40O75150 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF40O75150 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RNF40O75150 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RNF40O75150 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RNF40O75150 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF40O75150 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF40O75150 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF40O75150 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNF40O75150 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF40O75150 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF40O75150 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF40O75150 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF40O75150 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF40O75150 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF40O75150 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF40O75150 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF40O75150 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RNF40O75150 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RNF40O75150 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF40O75150 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF40O75150 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNF40O75150 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RNF40O75150 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNF40O75150 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF40O75150 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF40O75150 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF40O75150 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF40O75150 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF40O75150 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF40O75150 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF40O75150 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RNF40O75150 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RNF40O75150 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNF40O75150 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF40O75150 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF40O75150 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF40O75150 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF40O75150 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RNF40O75150 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF40O75150 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF40O75150 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF40O75150 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF40O75150 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF40O75150 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF40O75150 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF40O75150 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF40O75150 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF40O75150 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RNF40O75150 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF40O75150 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF40O75150 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF40O75150 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF40O75150 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF40O75150 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF40O75150 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF40O75150 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF40O75150 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF40O75150 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF40O75150 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF40O75150 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF40O75150 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF40O75150 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF40O75150 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF40O75150 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF40O75150 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms