Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RRP9O43818 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RRP9O43818 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRP9O43818 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRP9O43818 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRP9O43818 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RRP9O43818 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRP9O43818 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRP9O43818 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRP9O43818 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRP9O43818 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRP9O43818 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRP9O43818 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RRP9O43818 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRP9O43818 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRP9O43818 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRP9O43818 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRP9O43818 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRP9O43818 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRP9O43818 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRP9O43818 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRP9O43818 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RRP9O43818 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RRP9O43818 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RRP9O43818 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RRP9O43818 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RRP9O43818 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RRP9O43818 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RRP9O43818 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RRP9O43818 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RRP9O43818 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RRP9O43818 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RRP9O43818 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RRP9O43818 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RRP9O43818 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RRP9O43818 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRP9O43818 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRP9O43818 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RRP9O43818 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RRP9O43818 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RRP9O43818 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RRP9O43818 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RRP9O43818 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRP9O43818 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRP9O43818 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRP9O43818 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RRP9O43818 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RRP9O43818 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RRP9O43818 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RRP9O43818 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
RRP9O43818 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRP9O43818 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRP9O43818 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RRP9O43818 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP9O43818 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRP9O43818 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RRP9O43818 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRP9O43818 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP9O43818 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP9O43818 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRP9O43818 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRP9O43818 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRP9O43818 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRP9O43818 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRP9O43818 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRP9O43818 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RRP9O43818 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RRP9O43818 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RRP9O43818 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RRP9O43818 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRP9O43818 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRP9O43818 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RRP9O43818 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RRP9O43818 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RRP9O43818 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRP9O43818 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRP9O43818 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRP9O43818 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RRP9O43818 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RRP9O43818 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RRP9O43818 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RRP9O43818 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RRP9O43818 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RRP9O43818 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RRP9O43818 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RRP9O43818 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RRP9O43818 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RRP9O43818 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RRP9O43818 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RRP9O43818 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRP9O43818 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRP9O43818 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRP9O43818 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP9O43818 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP9O43818 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
RRP9O43818 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
RRP9O43818 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP9O43818 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRP9O43818 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRP9O43818 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms