Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SGTAO43765 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SGTAO43765 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SGTAO43765 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SGTAO43765 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SGTAO43765 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SGTAO43765 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SGTAO43765 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SGTAO43765 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SGTAO43765 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SGTAO43765 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SGTAO43765 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SGTAO43765 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SGTAO43765 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SGTAO43765 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SGTAO43765 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SGTAO43765 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SGTAO43765 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGTAO43765 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGTAO43765 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SGTAO43765 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SGTAO43765 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SGTAO43765 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SGTAO43765 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SGTAO43765 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGTAO43765 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SGTAO43765 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SGTAO43765 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SGTAO43765 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SGTAO43765 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGTAO43765 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGTAO43765 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGTAO43765 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGTAO43765 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGTAO43765 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SGTAO43765 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SGTAO43765 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SGTAO43765 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SGTAO43765 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SGTAO43765 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SGTAO43765 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SGTAO43765 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGTAO43765 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGTAO43765 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SGTAO43765 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SGTAO43765 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SGTAO43765 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SGTAO43765 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SGTAO43765 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGTAO43765 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SGTAO43765 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGTAO43765 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SGTAO43765 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SGTAO43765 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SGTAO43765 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SGTAO43765 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SGTAO43765 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SGTAO43765 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SGTAO43765 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SGTAO43765 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SGTAO43765 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SGTAO43765 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SGTAO43765 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SGTAO43765 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SGTAO43765 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SGTAO43765 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SGTAO43765 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SGTAO43765 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SGTAO43765 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SGTAO43765 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SGTAO43765 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SGTAO43765 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SGTAO43765 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SGTAO43765 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SGTAO43765 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SGTAO43765 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SGTAO43765 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SGTAO43765 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SGTAO43765 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SGTAO43765 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SGTAO43765 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SGTAO43765 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SGTAO43765 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SGTAO43765 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SGTAO43765 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SGTAO43765 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SGTAO43765 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SGTAO43765 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SGTAO43765 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SGTAO43765 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SGTAO43765 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SGTAO43765 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SGTAO43765 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SGTAO43765 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SGTAO43765 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SGTAO43765 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGTAO43765 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGTAO43765 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SGTAO43765 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGTAO43765 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 305.1 ms