Protein–RNA interactions for Protein: O43586

PSTPIP1, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSTPIP1O43586 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSTPIP1O43586 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSTPIP1O43586 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSTPIP1O43586 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSTPIP1O43586 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSTPIP1O43586 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSTPIP1O43586 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSTPIP1O43586 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSTPIP1O43586 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSTPIP1O43586 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSTPIP1O43586 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSTPIP1O43586 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSTPIP1O43586 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSTPIP1O43586 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSTPIP1O43586 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSTPIP1O43586 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSTPIP1O43586 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSTPIP1O43586 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSTPIP1O43586 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSTPIP1O43586 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSTPIP1O43586 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PSTPIP1O43586 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSTPIP1O43586 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSTPIP1O43586 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSTPIP1O43586 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSTPIP1O43586 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSTPIP1O43586 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSTPIP1O43586 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSTPIP1O43586 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSTPIP1O43586 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSTPIP1O43586 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSTPIP1O43586 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PSTPIP1O43586 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSTPIP1O43586 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSTPIP1O43586 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSTPIP1O43586 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSTPIP1O43586 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PSTPIP1O43586 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSTPIP1O43586 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSTPIP1O43586 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSTPIP1O43586 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSTPIP1O43586 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSTPIP1O43586 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSTPIP1O43586 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSTPIP1O43586 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSTPIP1O43586 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSTPIP1O43586 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSTPIP1O43586 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSTPIP1O43586 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSTPIP1O43586 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSTPIP1O43586 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSTPIP1O43586 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSTPIP1O43586 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSTPIP1O43586 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PSTPIP1O43586 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PSTPIP1O43586 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSTPIP1O43586 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSTPIP1O43586 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSTPIP1O43586 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSTPIP1O43586 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSTPIP1O43586 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSTPIP1O43586 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSTPIP1O43586 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSTPIP1O43586 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSTPIP1O43586 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSTPIP1O43586 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PSTPIP1O43586 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSTPIP1O43586 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PSTPIP1O43586 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSTPIP1O43586 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSTPIP1O43586 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSTPIP1O43586 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSTPIP1O43586 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSTPIP1O43586 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSTPIP1O43586 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSTPIP1O43586 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSTPIP1O43586 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSTPIP1O43586 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSTPIP1O43586 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSTPIP1O43586 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSTPIP1O43586 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSTPIP1O43586 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSTPIP1O43586 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSTPIP1O43586 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSTPIP1O43586 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSTPIP1O43586 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSTPIP1O43586 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSTPIP1O43586 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSTPIP1O43586 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PSTPIP1O43586 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSTPIP1O43586 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSTPIP1O43586 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSTPIP1O43586 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSTPIP1O43586 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSTPIP1O43586 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSTPIP1O43586 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSTPIP1O43586 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSTPIP1O43586 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSTPIP1O43586 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSTPIP1O43586 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms