Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHUKO15111 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHUKO15111 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHUKO15111 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHUKO15111 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHUKO15111 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CHUKO15111 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHUKO15111 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHUKO15111 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHUKO15111 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHUKO15111 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CHUKO15111 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHUKO15111 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHUKO15111 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHUKO15111 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHUKO15111 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHUKO15111 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHUKO15111 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHUKO15111 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHUKO15111 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHUKO15111 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHUKO15111 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHUKO15111 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHUKO15111 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHUKO15111 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHUKO15111 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHUKO15111 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHUKO15111 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHUKO15111 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHUKO15111 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHUKO15111 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHUKO15111 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHUKO15111 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHUKO15111 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHUKO15111 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHUKO15111 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHUKO15111 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHUKO15111 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHUKO15111 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHUKO15111 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHUKO15111 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHUKO15111 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHUKO15111 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHUKO15111 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHUKO15111 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHUKO15111 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHUKO15111 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHUKO15111 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHUKO15111 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHUKO15111 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHUKO15111 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHUKO15111 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHUKO15111 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHUKO15111 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHUKO15111 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHUKO15111 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHUKO15111 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHUKO15111 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHUKO15111 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHUKO15111 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHUKO15111 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHUKO15111 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHUKO15111 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHUKO15111 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHUKO15111 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHUKO15111 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHUKO15111 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHUKO15111 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHUKO15111 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHUKO15111 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHUKO15111 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHUKO15111 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHUKO15111 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHUKO15111 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHUKO15111 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHUKO15111 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHUKO15111 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHUKO15111 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHUKO15111 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHUKO15111 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHUKO15111 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHUKO15111 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHUKO15111 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHUKO15111 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHUKO15111 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHUKO15111 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHUKO15111 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHUKO15111 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHUKO15111 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHUKO15111 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHUKO15111 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHUKO15111 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHUKO15111 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHUKO15111 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHUKO15111 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHUKO15111 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.58■■■□□ 2
CHUKO15111 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHUKO15111 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHUKO15111 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHUKO15111 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms