Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CEP290O15078 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
CEP290O15078 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CEP290O15078 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CEP290O15078 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CEP290O15078 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CEP290O15078 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CEP290O15078 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CEP290O15078 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CEP290O15078 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
CEP290O15078 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CEP290O15078 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CEP290O15078 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CEP290O15078 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
CEP290O15078 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CEP290O15078 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
CEP290O15078 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CEP290O15078 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CEP290O15078 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CEP290O15078 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CEP290O15078 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CEP290O15078 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CEP290O15078 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CEP290O15078 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CEP290O15078 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CEP290O15078 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CEP290O15078 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CEP290O15078 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CEP290O15078 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CEP290O15078 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CEP290O15078 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CEP290O15078 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CEP290O15078 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CEP290O15078 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CEP290O15078 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CEP290O15078 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CEP290O15078 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CEP290O15078 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CEP290O15078 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
CEP290O15078 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
CEP290O15078 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
CEP290O15078 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CEP290O15078 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CEP290O15078 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
CEP290O15078 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CEP290O15078 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CEP290O15078 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CEP290O15078 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CEP290O15078 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CEP290O15078 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CEP290O15078 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CEP290O15078 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CEP290O15078 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CEP290O15078 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CEP290O15078 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CEP290O15078 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP290O15078 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP290O15078 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CEP290O15078 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CEP290O15078 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CEP290O15078 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CEP290O15078 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CEP290O15078 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
CEP290O15078 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
CEP290O15078 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CEP290O15078 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CEP290O15078 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CEP290O15078 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CEP290O15078 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CEP290O15078 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CEP290O15078 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CEP290O15078 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CEP290O15078 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CEP290O15078 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CEP290O15078 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CEP290O15078 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CEP290O15078 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CEP290O15078 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CEP290O15078 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CEP290O15078 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CEP290O15078 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CEP290O15078 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CEP290O15078 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CEP290O15078 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CEP290O15078 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CEP290O15078 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CEP290O15078 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CEP290O15078 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CEP290O15078 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CEP290O15078 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CEP290O15078 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CEP290O15078 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CEP290O15078 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CEP290O15078 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CEP290O15078 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CEP290O15078 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CEP290O15078 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CEP290O15078 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CEP290O15078 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CEP290O15078 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
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