Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAPN9O14815 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAPN9O14815 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAPN9O14815 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAPN9O14815 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAPN9O14815 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAPN9O14815 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAPN9O14815 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAPN9O14815 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAPN9O14815 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAPN9O14815 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAPN9O14815 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAPN9O14815 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAPN9O14815 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAPN9O14815 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAPN9O14815 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAPN9O14815 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAPN9O14815 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAPN9O14815 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPN9O14815 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPN9O14815 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CAPN9O14815 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAPN9O14815 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CAPN9O14815 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAPN9O14815 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAPN9O14815 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAPN9O14815 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAPN9O14815 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAPN9O14815 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAPN9O14815 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAPN9O14815 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAPN9O14815 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CAPN9O14815 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CAPN9O14815 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAPN9O14815 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAPN9O14815 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAPN9O14815 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAPN9O14815 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAPN9O14815 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAPN9O14815 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAPN9O14815 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAPN9O14815 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAPN9O14815 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CAPN9O14815 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAPN9O14815 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPN9O14815 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPN9O14815 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPN9O14815 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAPN9O14815 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAPN9O14815 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAPN9O14815 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAPN9O14815 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAPN9O14815 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPN9O14815 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPN9O14815 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAPN9O14815 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPN9O14815 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPN9O14815 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPN9O14815 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPN9O14815 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPN9O14815 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPN9O14815 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPN9O14815 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPN9O14815 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPN9O14815 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPN9O14815 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPN9O14815 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CAPN9O14815 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAPN9O14815 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAPN9O14815 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAPN9O14815 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAPN9O14815 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAPN9O14815 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CAPN9O14815 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAPN9O14815 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAPN9O14815 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAPN9O14815 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAPN9O14815 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAPN9O14815 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAPN9O14815 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAPN9O14815 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAPN9O14815 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAPN9O14815 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAPN9O14815 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAPN9O14815 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAPN9O14815 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CAPN9O14815 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CAPN9O14815 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAPN9O14815 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CAPN9O14815 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAPN9O14815 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CAPN9O14815 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPN9O14815 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPN9O14815 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAPN9O14815 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAPN9O14815 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAPN9O14815 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAPN9O14815 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAPN9O14815 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAPN9O14815 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms