Protein–RNA interactions for Protein: O00160

MYO1F, Unconventional myosin-If, humanhuman

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1FO00160 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYO1FO00160 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYO1FO00160 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYO1FO00160 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYO1FO00160 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYO1FO00160 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MYO1FO00160 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MYO1FO00160 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MYO1FO00160 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MYO1FO00160 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYO1FO00160 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MYO1FO00160 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MYO1FO00160 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MYO1FO00160 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MYO1FO00160 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MYO1FO00160 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MYO1FO00160 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MYO1FO00160 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MYO1FO00160 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MYO1FO00160 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MYO1FO00160 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MYO1FO00160 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MYO1FO00160 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
MYO1FO00160 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MYO1FO00160 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MYO1FO00160 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MYO1FO00160 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MYO1FO00160 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MYO1FO00160 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MYO1FO00160 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MYO1FO00160 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MYO1FO00160 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MYO1FO00160 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MYO1FO00160 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MYO1FO00160 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
MYO1FO00160 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYO1FO00160 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYO1FO00160 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MYO1FO00160 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MYO1FO00160 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MYO1FO00160 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
MYO1FO00160 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MYO1FO00160 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MYO1FO00160 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MYO1FO00160 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MYO1FO00160 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MYO1FO00160 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MYO1FO00160 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MYO1FO00160 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MYO1FO00160 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MYO1FO00160 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYO1FO00160 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYO1FO00160 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYO1FO00160 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MYO1FO00160 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MYO1FO00160 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MYO1FO00160 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MYO1FO00160 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MYO1FO00160 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MYO1FO00160 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MYO1FO00160 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MYO1FO00160 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
MYO1FO00160 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
MYO1FO00160 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MYO1FO00160 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MYO1FO00160 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MYO1FO00160 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MYO1FO00160 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MYO1FO00160 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MYO1FO00160 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MYO1FO00160 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MYO1FO00160 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MYO1FO00160 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MYO1FO00160 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MYO1FO00160 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYO1FO00160 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYO1FO00160 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYO1FO00160 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MYO1FO00160 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MYO1FO00160 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYO1FO00160 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYO1FO00160 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYO1FO00160 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYO1FO00160 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYO1FO00160 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYO1FO00160 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYO1FO00160 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYO1FO00160 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYO1FO00160 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYO1FO00160 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYO1FO00160 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYO1FO00160 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYO1FO00160 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYO1FO00160 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYO1FO00160 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYO1FO00160 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYO1FO00160 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYO1FO00160 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYO1FO00160 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYO1FO00160 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms