Protein–RNA interactions for Protein: H3BQZ7

HNRNPUL2-BSCL2, HCG2044799, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC44.57■■■■■ 4.73
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC44.55■■■■■ 4.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC44.55■■■■■ 4.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC44.51■■■■■ 4.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC44.48■■■■■ 4.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.71
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC44.44■■■■■ 4.7
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC44.38■■■■■ 4.7
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.7
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC44.36■■■■■ 4.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC44.34■■■■■ 4.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC44.28■■■■■ 4.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC44.24■■■■■ 4.67
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC44.2■■■■■ 4.67
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC44.17■■■■■ 4.66
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.15■■■■■ 4.66
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC44.1■■■■■ 4.65
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC44.08■■■■■ 4.65
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC44.05■■■■■ 4.64
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC44.03■■■■■ 4.64
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC44.02■■■■■ 4.64
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.93■■■■■ 4.62
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC43.93■■■■■ 4.62
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC43.92■■■■■ 4.62
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC43.88■■■■■ 4.62
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC43.87■■■■■ 4.61
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.85■■■■■ 4.61
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.84■■■■■ 4.61
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC43.82■■■■■ 4.61
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC43.82■■■■■ 4.61
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC43.79■■■■■ 4.6
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.74■■■■■ 4.59
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC43.72■■■■■ 4.59
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC43.72■■■■■ 4.59
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC43.7■■■■■ 4.59
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.7■■■■■ 4.59
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC43.69■■■■■ 4.58
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.58■■■■■ 4.57
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms