Protein–RNA interactions for Protein: E9PJ23

NPIPB6, Nuclear pore complex-interacting protein family member B6, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB6E9PJ23 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB6E9PJ23 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPIPB6E9PJ23 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB6E9PJ23 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB6E9PJ23 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPIPB6E9PJ23 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB6E9PJ23 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB6E9PJ23 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB6E9PJ23 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPIPB6E9PJ23 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPIPB6E9PJ23 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB6E9PJ23 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB6E9PJ23 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB6E9PJ23 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB6E9PJ23 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB6E9PJ23 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB6E9PJ23 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NPIPB6E9PJ23 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NPIPB6E9PJ23 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPB6E9PJ23 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPIPB6E9PJ23 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPIPB6E9PJ23 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPIPB6E9PJ23 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPIPB6E9PJ23 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPIPB6E9PJ23 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPIPB6E9PJ23 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPIPB6E9PJ23 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPIPB6E9PJ23 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NPIPB6E9PJ23 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPIPB6E9PJ23 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPIPB6E9PJ23 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPIPB6E9PJ23 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPIPB6E9PJ23 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPIPB6E9PJ23 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NPIPB6E9PJ23 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NPIPB6E9PJ23 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NPIPB6E9PJ23 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NPIPB6E9PJ23 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NPIPB6E9PJ23 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NPIPB6E9PJ23 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NPIPB6E9PJ23 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NPIPB6E9PJ23 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NPIPB6E9PJ23 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NPIPB6E9PJ23 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NPIPB6E9PJ23 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NPIPB6E9PJ23 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NPIPB6E9PJ23 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NPIPB6E9PJ23 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NPIPB6E9PJ23 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NPIPB6E9PJ23 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NPIPB6E9PJ23 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NPIPB6E9PJ23 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NPIPB6E9PJ23 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NPIPB6E9PJ23 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NPIPB6E9PJ23 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NPIPB6E9PJ23 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPIPB6E9PJ23 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPIPB6E9PJ23 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPIPB6E9PJ23 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPIPB6E9PJ23 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPIPB6E9PJ23 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPIPB6E9PJ23 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPB6E9PJ23 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPB6E9PJ23 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPB6E9PJ23 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPB6E9PJ23 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPB6E9PJ23 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NPIPB6E9PJ23 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPIPB6E9PJ23 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NPIPB6E9PJ23 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPIPB6E9PJ23 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPIPB6E9PJ23 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NPIPB6E9PJ23 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NPIPB6E9PJ23 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NPIPB6E9PJ23 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NPIPB6E9PJ23 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NPIPB6E9PJ23 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NPIPB6E9PJ23 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NPIPB6E9PJ23 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NPIPB6E9PJ23 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NPIPB6E9PJ23 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NPIPB6E9PJ23 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NPIPB6E9PJ23 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NPIPB6E9PJ23 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NPIPB6E9PJ23 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NPIPB6E9PJ23 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NPIPB6E9PJ23 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NPIPB6E9PJ23 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NPIPB6E9PJ23 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NPIPB6E9PJ23 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NPIPB6E9PJ23 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NPIPB6E9PJ23 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NPIPB6E9PJ23 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NPIPB6E9PJ23 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NPIPB6E9PJ23 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NPIPB6E9PJ23 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NPIPB6E9PJ23 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NPIPB6E9PJ23 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NPIPB6E9PJ23 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NPIPB6E9PJ23 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms