Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DIRC3C9JPN6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DIRC3C9JPN6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DIRC3C9JPN6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
DIRC3C9JPN6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DIRC3C9JPN6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DIRC3C9JPN6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DIRC3C9JPN6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DIRC3C9JPN6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DIRC3C9JPN6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DIRC3C9JPN6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DIRC3C9JPN6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DIRC3C9JPN6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DIRC3C9JPN6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DIRC3C9JPN6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DIRC3C9JPN6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DIRC3C9JPN6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DIRC3C9JPN6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DIRC3C9JPN6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DIRC3C9JPN6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DIRC3C9JPN6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DIRC3C9JPN6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DIRC3C9JPN6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DIRC3C9JPN6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DIRC3C9JPN6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DIRC3C9JPN6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DIRC3C9JPN6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DIRC3C9JPN6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DIRC3C9JPN6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DIRC3C9JPN6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DIRC3C9JPN6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DIRC3C9JPN6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DIRC3C9JPN6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DIRC3C9JPN6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DIRC3C9JPN6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DIRC3C9JPN6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DIRC3C9JPN6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DIRC3C9JPN6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DIRC3C9JPN6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DIRC3C9JPN6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DIRC3C9JPN6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DIRC3C9JPN6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DIRC3C9JPN6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DIRC3C9JPN6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DIRC3C9JPN6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DIRC3C9JPN6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DIRC3C9JPN6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DIRC3C9JPN6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DIRC3C9JPN6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DIRC3C9JPN6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DIRC3C9JPN6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DIRC3C9JPN6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DIRC3C9JPN6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DIRC3C9JPN6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DIRC3C9JPN6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DIRC3C9JPN6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DIRC3C9JPN6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DIRC3C9JPN6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DIRC3C9JPN6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DIRC3C9JPN6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DIRC3C9JPN6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DIRC3C9JPN6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DIRC3C9JPN6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DIRC3C9JPN6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DIRC3C9JPN6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DIRC3C9JPN6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DIRC3C9JPN6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DIRC3C9JPN6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DIRC3C9JPN6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DIRC3C9JPN6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DIRC3C9JPN6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DIRC3C9JPN6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DIRC3C9JPN6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DIRC3C9JPN6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
DIRC3C9JPN6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DIRC3C9JPN6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DIRC3C9JPN6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DIRC3C9JPN6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DIRC3C9JPN6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DIRC3C9JPN6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DIRC3C9JPN6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DIRC3C9JPN6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DIRC3C9JPN6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DIRC3C9JPN6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DIRC3C9JPN6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DIRC3C9JPN6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DIRC3C9JPN6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DIRC3C9JPN6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DIRC3C9JPN6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DIRC3C9JPN6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DIRC3C9JPN6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DIRC3C9JPN6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DIRC3C9JPN6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DIRC3C9JPN6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DIRC3C9JPN6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DIRC3C9JPN6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DIRC3C9JPN6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DIRC3C9JPN6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DIRC3C9JPN6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DIRC3C9JPN6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms